246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3214 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 
668 aa  1330    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  48.65 
 
 
657 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  49.09 
 
 
748 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6734  5'-Nucleotidase domain protein  43.5 
 
 
726 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  45.83 
 
 
808 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  44.73 
 
 
1355 aa  482  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  44.07 
 
 
2775 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.06 
 
 
2667 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.48 
 
 
980 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  39.65 
 
 
2852 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  38.78 
 
 
2796 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.15 
 
 
3977 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  33.73 
 
 
613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  32.25 
 
 
619 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  32.25 
 
 
619 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.55 
 
 
555 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.02 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.69 
 
 
520 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3844  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.49 
 
 
712 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.35 
 
 
607 aa  168  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.71 
 
 
605 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  30.11 
 
 
558 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.22 
 
 
657 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.04 
 
 
659 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2776  5'-Nucleotidase domain protein  31.85 
 
 
603 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.64 
 
 
533 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.96 
 
 
638 aa  143  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.56 
 
 
627 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  26.38 
 
 
526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  29.57 
 
 
529 aa  137  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27.63 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  25.7 
 
 
663 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 
523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.42 
 
 
523 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.75 
 
 
672 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.54 
 
 
508 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  25.05 
 
 
619 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.29 
 
 
601 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  25.52 
 
 
581 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  25 
 
 
664 aa  97.8  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  24.58 
 
 
607 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
523 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  23.73 
 
 
504 aa  95.5  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  23.24 
 
 
582 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.08 
 
 
508 aa  89  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.08 
 
 
508 aa  89  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.29 
 
 
509 aa  88.6  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  33.86 
 
 
1506 aa  84.7  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  23.4 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  23.08 
 
 
529 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  23.73 
 
 
1311 aa  83.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  23.24 
 
 
529 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  23.24 
 
 
529 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.57 
 
 
512 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  33.61 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  23.36 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  23.24 
 
 
529 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  23.08 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  23.08 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  23.08 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.86 
 
 
529 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  22.15 
 
 
530 aa  80.1  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  27.9 
 
 
506 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.5 
 
 
578 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  26.52 
 
 
637 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1951  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.88 
 
 
588 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00846819  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  23.72 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  26.52 
 
 
637 aa  78.2  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  24.46 
 
 
1577 aa  77.8  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2021  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.45 
 
 
571 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000125326  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.56 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  24.22 
 
 
558 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  23.9 
 
 
529 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.4 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  23.69 
 
 
529 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  24.24 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  24.1 
 
 
529 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  22.89 
 
 
529 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.75 
 
 
529 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  26.16 
 
 
1577 aa  73.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  23.29 
 
 
529 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  23.49 
 
 
529 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  23.29 
 
 
529 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  23.69 
 
 
529 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  23.49 
 
 
529 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  21.72 
 
 
638 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1952  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.16 
 
 
569 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643025  normal  0.0714944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  22.38 
 
 
607 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2309  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.69 
 
 
572 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  23.83 
 
 
1512 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.83 
 
 
515 aa  71.2  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  24.2 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  23.64 
 
 
559 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  23.15 
 
 
556 aa  70.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2001  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.88 
 
 
569 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.39 
 
 
591 aa  70.5  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  22.77 
 
 
1652 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.78 
 
 
1525 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02665  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.89 
 
 
578 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  22.11 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>