More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2012 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  807    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  63.97 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  63.53 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  63.05 
 
 		 422 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  63.64 
 
 		 423 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  64.48 
 
 		 415 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  59.51 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 417 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  44.18 
 
 		 411 aa  307  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 403 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  31.03 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  34.47 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  28.79 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  28.38 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  28.38 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  29.95 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  29.49 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  30.23 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  29.77 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  28.8 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  29.61 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  30.1 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  30.1 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  30.1 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  30.1 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  30.1 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  31.06 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  25.63 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.55 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  26.3 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  25.52 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  26.1 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  26.1 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  25 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>