More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0286 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  660    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  69.04 
 
 		 324 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  68.73 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  74.24 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  70.92 
 
 		 327 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  68.71 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  62.58 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  41.02 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  41.86 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  42.75 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  35.03 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  35.71 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  39.5 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  34.29 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  37.23 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  34.35 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.99 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  35.44 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.64 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  38.54 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2145  hypothetical protein  34.15 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.467573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.83 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.79 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  34.33 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.35 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.8 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.8 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.79 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  37.39 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  34.47 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  33.77 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  36.15 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  33.84 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  36.96 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  35.59 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  36.88 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  36.69 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  35.02 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.63 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  35.41 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.46 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  35.79 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  35.31 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.46 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  34.45 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  36.39 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.26 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  32.51 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  35.76 
 
 		 349 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  34.49 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.23 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  34.26 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  34.81 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 328 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.02 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  33.44 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0911  hypothetical protein  37.46 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  34.06 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  32.88 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  35.02 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.8 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.63 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  34.72 
 
 		 334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  35.22 
 
 		 330 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  32.19 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  32.54 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  33.12 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  32.32 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  31.86 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1653  hypothetical protein  36.25 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.386513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  34.93 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  34.36 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  37.58 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  33.44 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.92 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  34.1 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  33.13 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  34.18 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  35 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  35.03 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.23 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  33.94 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.02 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  34.45 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4067  extra-cytoplasmic solute receptor  34.56 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0118561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  33.74 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.45 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  32.66 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  36.45 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  31.86 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  31.85 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  30.59 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  33.44 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  31.31 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>