More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1610 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1610  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  100 
 
 
234 aa  480  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0217  ABC transporter related  42.33 
 
 
223 aa  168  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000121534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1721  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  42.18 
 
 
219 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0049176  normal  0.88326 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1187  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  39.39 
 
 
222 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0804  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.9 
 
 
228 aa  154  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.321319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  35.91 
 
 
273 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  34.74 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  33.01 
 
 
237 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  33.19 
 
 
252 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  32.64 
 
 
249 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  29.17 
 
 
258 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  32.72 
 
 
263 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  34.67 
 
 
271 aa  121  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  33.94 
 
 
251 aa  121  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  31.84 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  29.49 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  33.49 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  29.22 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  31.98 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  32.04 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  32.4 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  33.68 
 
 
240 aa  119  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  31.25 
 
 
271 aa  118  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  31.1 
 
 
249 aa  118  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  31.55 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  30.85 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.55 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  31.55 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  31.55 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  31.53 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  31.53 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 
256 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  33.99 
 
 
257 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  32.08 
 
 
287 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  32.04 
 
 
257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
245 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  31.02 
 
 
221 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  29.52 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  35.64 
 
 
254 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  33 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  31.44 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  31.75 
 
 
240 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  30.93 
 
 
251 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  31.37 
 
 
259 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  31.75 
 
 
240 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  30.84 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  28.7 
 
 
247 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  35.18 
 
 
273 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
230 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  30.39 
 
 
221 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  29.95 
 
 
252 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  30.19 
 
 
250 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  30.58 
 
 
248 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  33 
 
 
252 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 
250 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  33.17 
 
 
259 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.64 
 
 
251 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  30.61 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  31.6 
 
 
222 aa  111  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  31.34 
 
 
294 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  32.02 
 
 
258 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  32.66 
 
 
257 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.53 
 
 
363 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  31.31 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  30.62 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.83 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  32.55 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  36.73 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  32.5 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  31.98 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  35.83 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  29.77 
 
 
265 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  28.38 
 
 
249 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  29.35 
 
 
262 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  30.57 
 
 
252 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  33.51 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  35.84 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  34.3 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  34.44 
 
 
276 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  35.83 
 
 
248 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  29.56 
 
 
243 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 
247 aa  108  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  28.12 
 
 
258 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  30.73 
 
 
251 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  30.73 
 
 
251 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  30.73 
 
 
251 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 
251 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  30.73 
 
 
251 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>