More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0819 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0819  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
484 aa  1006    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  51.26 
 
 
479 aa  503  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.06 
 
 
489 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.11 
 
 
494 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.94 
 
 
505 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.77 
 
 
495 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  43.61 
 
 
490 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  42.09 
 
 
495 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.74 
 
 
506 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  41.48 
 
 
493 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  41.48 
 
 
494 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  43.57 
 
 
491 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  43.3 
 
 
491 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  43.36 
 
 
491 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.94 
 
 
494 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.8 
 
 
495 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.09 
 
 
493 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  43.15 
 
 
491 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.48 
 
 
495 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  41.43 
 
 
491 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  42.06 
 
 
580 aa  369  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  42.92 
 
 
491 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.74 
 
 
461 aa  364  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.13 
 
 
493 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  40.2 
 
 
496 aa  363  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  42.83 
 
 
481 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.26 
 
 
492 aa  362  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.33 
 
 
493 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  38.64 
 
 
2126 aa  361  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  42 
 
 
481 aa  360  3e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  40.49 
 
 
475 aa  359  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.55 
 
 
488 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  42 
 
 
481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  39.03 
 
 
2126 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  41.65 
 
 
492 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  40.91 
 
 
472 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.88 
 
 
484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.44 
 
 
487 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.2 
 
 
482 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.03 
 
 
489 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  40.94 
 
 
489 aa  348  8e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  40.53 
 
 
489 aa  346  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  40.04 
 
 
485 aa  346  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  40.33 
 
 
471 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  41.86 
 
 
488 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11010  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.06 
 
 
486 aa  344  2e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.709567  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  37.91 
 
 
502 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  39.6 
 
 
502 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  39.6 
 
 
502 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.37 
 
 
485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  39.48 
 
 
494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  38.42 
 
 
492 aa  343  5e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  39.41 
 
 
502 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  38.92 
 
 
477 aa  342  9e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  39.92 
 
 
485 aa  342  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  39 
 
 
477 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  38.32 
 
 
488 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  40.7 
 
 
472 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  40.37 
 
 
484 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.25 
 
 
488 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  38.04 
 
 
492 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  38.92 
 
 
500 aa  340  5e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  40.16 
 
 
501 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  39.15 
 
 
492 aa  339  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  39.24 
 
 
491 aa  339  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  39.92 
 
 
2135 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  38.67 
 
 
477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  38.67 
 
 
477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  41.35 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  41.35 
 
 
489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  41.51 
 
 
492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  39.96 
 
 
484 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  39.25 
 
 
484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  37.86 
 
 
487 aa  336  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  40.74 
 
 
484 aa  336  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1504  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.53 
 
 
488 aa  336  5e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  38.52 
 
 
487 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40 
 
 
484 aa  336  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  38.52 
 
 
487 aa  335  7e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2941  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  38.69 
 
 
501 aa  335  9e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0286232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  37.75 
 
 
488 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  39.63 
 
 
489 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  37.7 
 
 
488 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  41.3 
 
 
491 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  37.92 
 
 
488 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2216  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.08 
 
 
488 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  39.36 
 
 
502 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  37.5 
 
 
488 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  39.31 
 
 
490 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  39.92 
 
 
485 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1981  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  39.84 
 
 
491 aa  332  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.376175  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  37.58 
 
 
486 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  39.38 
 
 
484 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  36.83 
 
 
489 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  39.22 
 
 
486 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1220  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.34 
 
 
487 aa  331  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.462072  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  38.96 
 
 
496 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  38.89 
 
 
484 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  38.6 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  36.63 
 
 
489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>