151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0595 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  100 
 
 
366 aa  694    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  35.08 
 
 
368 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  38.24 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  38.24 
 
 
383 aa  195  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  37.93 
 
 
383 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  37.09 
 
 
383 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  37.09 
 
 
383 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  37.93 
 
 
383 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  37.18 
 
 
383 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  38.51 
 
 
409 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  35.29 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  35.96 
 
 
377 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  33.62 
 
 
360 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  34.02 
 
 
370 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  29.04 
 
 
398 aa  150  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  28.49 
 
 
377 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  28.89 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  27.64 
 
 
395 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  30.29 
 
 
378 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  29.41 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  29.19 
 
 
382 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  28.71 
 
 
378 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  29.71 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  31.19 
 
 
376 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  28.88 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  30.06 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  29.35 
 
 
376 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  29.35 
 
 
376 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  28.82 
 
 
408 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  28 
 
 
370 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  30.68 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  27.72 
 
 
372 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  27.91 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  27.91 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  27.91 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  27.91 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  27.91 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  27.91 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  27.14 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  27.14 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  27.3 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  27.14 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  27.3 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  27.64 
 
 
372 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  27.17 
 
 
377 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  27.64 
 
 
372 aa  109  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  26.69 
 
 
383 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  26.69 
 
 
377 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  26.98 
 
 
377 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  26.39 
 
 
383 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  26.39 
 
 
377 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  26.39 
 
 
377 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  26.39 
 
 
377 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  26.3 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  32.78 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  25.21 
 
 
408 aa  89.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  28.12 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.15 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  24.37 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  26.02 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  22.61 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.8 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  27.08 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  26.64 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  25.19 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  22.98 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  25.92 
 
 
427 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  23.41 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  25.49 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.49 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  23.63 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  23.96 
 
 
431 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  23.74 
 
 
429 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26.4 
 
 
429 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.47 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  23.64 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  21.81 
 
 
437 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  23.68 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  25.53 
 
 
415 aa  63.2  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  21.92 
 
 
431 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  25.35 
 
 
427 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  24 
 
 
421 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  21.87 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  28 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  21.87 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  24.8 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.78 
 
 
440 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  26.61 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.35 
 
 
424 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.88 
 
 
408 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.1 
 
 
428 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  29.3 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.3 
 
 
401 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  24.25 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  23.41 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  23.43 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  24.07 
 
 
384 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  22.64 
 
 
447 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  27.43 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  24.59 
 
 
441 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>