More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0038 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 401 aa  780    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  54.52 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  40.05 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  37.53 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  32.83 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  33.77 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 399 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  33.51 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  33.25 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  33.25 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  33.68 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 		 421 aa  206  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  31.32 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  31.28 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  31.42 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  28.13 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  28.02 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  28.28 
 
 		 381 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  28.13 
 
 		 381 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  27.76 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  28 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  28 
 
 		 506 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  28.92 
 
 		 506 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 505 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  30.65 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  30.39 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  30.39 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  30.39 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  28.65 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  29.35 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  29.46 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  29.13 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 410 aa  96.3  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.75 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  23.9 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  24.18 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  22.32 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2964  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000419603  hitchhiker  0.00000212995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  21.95 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  25.69 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.73 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.73 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.73 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.73 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.44 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.73 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.58 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.58 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.58 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.11 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2616  hypothetical protein  23.48 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.58 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  32.63 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>