84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1666 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1666  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  100 
 
 		 384 aa  794    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.696762  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2569  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  54.26 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2622  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  54.26 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2122  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  53.25 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1291  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.45 
 
 		 383 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1316  HMG-CoA synthase  51.03 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.717019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0621  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase (HMG-CoA synthase)  50.9 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000102903  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0676  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  48.96 
 
 		 385 aa  345  8.999999999999999e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000283469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1372  3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA synthase  47.29 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.998569  hitchhiker  0.00000000102593 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0359  putative hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  44.63 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1184  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  44.63 
 
 		 385 aa  318  7e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.298537  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8252  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  42.12 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1719  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  38.86 
 
 		 389 aa  299  5e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.396765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0968  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  42.64 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2884  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  34.22 
 
 		 419 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1670  polyketide biosynthesis protein  34.32 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1212  polyketide biosynthesis protein, interruption-N  33.33 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5295  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.35 
 
 		 417 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0778158  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1384  putative polyketide biosynthesis protein pksG  33.33 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1470  putative polyketide biosynthesis protein pksG  33.33 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0349844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2613  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  33.33 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.457692  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1418  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.55 
 
 		 420 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0678  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.37 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0215835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2608  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  29.78 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2518  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  29.78 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2601  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  33.24 
 
 		 424 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.914531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2595  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  31.81 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0828  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.17 
 
 		 464 aa  159  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0208074 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1931  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein  29.6 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.808673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4396  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  32.82 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2969  putative hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase  29.83 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  hitchhiker  0.0000211937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1179  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  30.19 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1739  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.12 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2310  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  30.05 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2313  Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase domain protein  28.94 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0401  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.16 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2766  Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  28.12 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04923  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, expressed (Eurofung)  26.94 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000140052  normal  0.183137 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_83020  predicted protein  27.6 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0703  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  29.43 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2510  hypothetical protein  27.93 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507027  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16649  predicted protein  25.26 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24052  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1627  hypothetical protein  27.42 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02670  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 		 492 aa  97.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250048  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  26.17 
 
 		 350 aa  96.3  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0157  hypothetical protein  28.28 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0020  hypothetical protein  25.15 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2361  hypothetical protein  27.33 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0551  hypothetical protein  27.19 
 
 		 349 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1646  hypothetical protein  27.08 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1932  hypothetical protein  25.62 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0292488  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0458  hypothetical protein  25.53 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.288502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1142  hypothetical protein  25.77 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448183  hitchhiker  0.000356194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0379  hypothetical protein  25.23 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05080  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative  28.25 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0146937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1461  hypothetical protein  25.23 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  25.77 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0338  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  25.68 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.468823  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0526  hypothetical protein  24.92 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0793  hypothetical protein  24.3 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  23.14 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1356  hypothetical protein  26.38 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0764  hypothetical protein  28.77 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1390  hypothetical protein  25.15 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1240  hypothetical protein  27.05 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0625222  hitchhiker  0.00968227 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0151  hypothetical protein  25.82 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3869  hypothetical protein  24.61 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0982  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0430  hypothetical protein  25.28 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.637557  normal  0.081806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1576  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.56 
 
 		 316 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.70406e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3501  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.56 
 
 		 316 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246754  decreased coverage  0.00135682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.56 
 
 		 316 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000249118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4809  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.46 
 
 		 315 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0509629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3240  hypothetical protein  24.48 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.57921  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1292  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.43 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000523087  hitchhiker  2.7964e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1307  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.43 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0184872  hitchhiker  0.000000000000113023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1263  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.43 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00141014  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1993  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.43 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302649  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2176  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.43 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00253287  hitchhiker  0.000000000000149939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002994  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASIII  28.57 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000798745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  23.15 
 
 		 334 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1423  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.31 
 
 		 323 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.495609  normal  0.708105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2408  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.97 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1609  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.01 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>