More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0435 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  213  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1825  thioredoxin  61.17 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000186182  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0177  thioredoxin family protein  57.84 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.366705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1252  thioredoxin domain-containing protein  56.67 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000389642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1437  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  55.17 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00152159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4444  thioredoxin  46.53 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1834  thioredoxin domain-containing protein  53.57 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.339161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1799  thioredoxin domain-containing protein  53.57 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4525  thioredoxin domain-containing protein  46.53 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4827  thioredoxin family protein  45.54 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0619703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  45.54 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  45.54 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  45.54 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  45.54 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  45.54 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  45.54 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3355  thioredoxin domain-containing protein  46.53 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4836  thioredoxin family protein  45.54 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2743  Thioredoxin domain protein  44.55 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1304  thioredoxin, putative  40.78 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000360749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1807  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.76 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.132216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  44.83 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0794  Thioredoxin domain protein  32.32 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  37.23 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  35.29 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1660  Thioredoxin domain protein  31.31 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0847  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00144466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0830  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1625  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  30.77 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000722607  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06230  thioredoxin  32.32 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  38.67 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  40.68 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  31.76 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  29.47 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2344  thioredoxin family protein  31 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.397592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2090  thioredoxin  31 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2293  thioredoxin  31 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  33.77 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2128  thioredoxin domain-containing protein  31 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.831253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2419  thioredoxin family protein  31 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3031  thioredoxin  31 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2094  thioredoxin  32.29 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000532276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2336  thioredoxin family protein  32.29 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1193  putative thioredoxin  32.05 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  33.33 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1701  thioredoxin domain-containing protein  27.08 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  30.77 
 
 		 406 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  30.68 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  29.41 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  30.59 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  32.88 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  27.78 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  35.87 
 
 		 269 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  34.25 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  31.46 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  40 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  29.41 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  30.99 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  35.59 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  32.88 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  30.86 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  27.5 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  29.41 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  34.67 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  31.46 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  31.91 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  34.85 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  34.88 
 
 		 338 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  26.37 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  26.37 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  26.37 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  33.33 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  33.8 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  32.5 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  30.61 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  30.61 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  31.71 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  30.95 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  29.76 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  27.17 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  32.39 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  29.41 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  32.22 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4232  putative thioredoxin  29.76 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514509  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf029  thioredoxin family member  30.26 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  34.85 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  28.72 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4265  Thioredoxin domain protein  28.89 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  32.18 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  30.86 
 
 		 768 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  32.39 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf030  thioredoxin family member  32.81 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  29.47 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>