More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 182 aa  353  7.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  53.85 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  52.15 
 
 		 433 aa  138  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  52.29 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  53.96 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  52.7 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  53.21 
 
 		 203 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  51.22 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  55.22 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  48.39 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  48.47 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  46.2 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  49.01 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  50 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  49.39 
 
 		 438 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  45.91 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.38 
 
 		 413 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  47.62 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  54.4 
 
 		 432 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  46.71 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  48.7 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0281  putative nucleotide-utilizing enzyme  46.06 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0125571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  66.38 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  52.21 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  44.05 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1486  CinA domain protein  56.92 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  47.88 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  40.96 
 
 		 425 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  45.21 
 
 		 414 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  43.6 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  44.52 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  41.1 
 
 		 415 aa  108  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  46.98 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 416 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  44.08 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  44.08 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  47.22 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  46.21 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  44.08 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  46.3 
 
 		 418 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  45.75 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.93 
 
 		 424 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  69.52 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  43.36 
 
 		 411 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  45.81 
 
 		 427 aa  100  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  41.89 
 
 		 413 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  36.14 
 
 		 415 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  57.14 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  39.76 
 
 		 432 aa  99.8  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  43.71 
 
 		 416 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  46.56 
 
 		 243 aa  99  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  40.91 
 
 		 423 aa  99  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  40.51 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 		 166 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  41.76 
 
 		 421 aa  98.2  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.63 
 
 		 433 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  41.72 
 
 		 420 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  39.88 
 
 		 415 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  41.21 
 
 		 413 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  39.19 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  42.57 
 
 		 413 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  43.05 
 
 		 415 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  44 
 
 		 410 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  33.95 
 
 		 408 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  40.74 
 
 		 416 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  45.33 
 
 		 408 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  33.95 
 
 		 408 aa  95.9  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  40.74 
 
 		 416 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  37.97 
 
 		 411 aa  95.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.76 
 
 		 431 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  45.33 
 
 		 408 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  42.76 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  42.68 
 
 		 420 aa  94.7  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  39.49 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  39.49 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  39.49 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  39.49 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  39.49 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  39.49 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  39.49 
 
 		 165 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  42.95 
 
 		 160 aa  94.4  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  28 
 
 		 275 aa  93.6  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  40.49 
 
 		 416 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  38.27 
 
 		 417 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  38.85 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  39.86 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10500  competence/damage-inducible protein CinA-like protein  46.51 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.620562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  37.8 
 
 		 413 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 		 412 aa  92.8  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  37.75 
 
 		 412 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  41.1 
 
 		 371 aa  92  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  42.86 
 
 		 208 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  37.34 
 
 		 413 aa  92  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  36 
 
 		 415 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  39.24 
 
 		 412 aa  91.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  39.87 
 
 		 431 aa  91.3  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  36.73 
 
 		 411 aa  90.9  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>