More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1833 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  62.7 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  62.92 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  60.36 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.56 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  57.68 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  55.56 
 
 		 242 aa  245  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  50.74 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  57.2 
 
 		 234 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  54.22 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  55.83 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  55.93 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  57.2 
 
 		 238 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  53.47 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  59.47 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  54.55 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  57.38 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  54.32 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  57.97 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  60.19 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  59.53 
 
 		 233 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  55.28 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  54.69 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  53.41 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  53.41 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  53.41 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  50.22 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  59.05 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 273 aa  198  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  48.22 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.45 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 198 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 207 aa  95.9  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 		 213 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.67 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.91 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.04 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.84 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.36 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.78 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  26.21 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.62 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.92 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.92 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.02 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.67 
 
 		 442 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  28.91 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.44 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  22.73 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  22.73 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.6 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  26.39 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.36 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.76 
 
 		 443 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>