101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1644 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1644  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
313 aa  598  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.560871  normal  0.0470073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2811  peptidase M48, Ste24p  49.85 
 
 
316 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00825905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2855  peptidase M48, Ste24p  49.85 
 
 
316 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2838  peptidase M48, Ste24p  49.85 
 
 
316 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2761  peptidase M48 Ste24p  45.34 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3088  peptidase M48, Ste24p  47.68 
 
 
311 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11873  hypothetical protein  46.53 
 
 
316 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0487185  normal  0.227257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2314  peptidase M48 Ste24p  48.18 
 
 
313 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3358  peptidase M48, Ste24p  47.54 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537093  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0306  peptidase M48 Ste24p  38.72 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0254  peptidase M48, Ste24p  38.38 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4975  hypothetical protein  36.66 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0950  hypothetical protein  39.93 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0685  peptidase M48 Ste24p  39.16 
 
 
301 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0489  peptidase M48 Ste24p  37.74 
 
 
304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.933964  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6582  peptidase M48 Ste24p  37.11 
 
 
431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0023  hypothetical protein  34.65 
 
 
316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611304  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1614  peptidase M48 Ste24p  35.82 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000360169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4543  peptidase M56 BlaR1  34.95 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0682901  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0824  peptidase M48, Ste24p  38.01 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2917  integral membrane protein  35.79 
 
 
314 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0768  peptidase M48 Ste24p  37.46 
 
 
301 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0413822  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37270  Zn-dependent protease with chaperone function  36.81 
 
 
297 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01850  Zn-dependent protease with chaperone function  35.25 
 
 
329 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4331  peptidase M48 Ste24p  34.67 
 
 
314 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1620  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0161303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3765  peptidase M48 Ste24p  35.79 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.511777  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5738  peptidase M48 Ste24p  34.11 
 
 
309 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5640  peptidase M48 Ste24p  31.79 
 
 
338 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2841  peptidase M48, Ste24p  43.51 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.353874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1968  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1349  peptidase M48 Ste24p  51.55 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5380  peptidase M48, Ste24p  30.66 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3608  peptidase M48 Ste24p  37.17 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154924  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5667  peptidase M48, Ste24p  30.17 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4562  peptidase M48, Ste24p  41.98 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5344  peptidase M48, Ste24p  30.17 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3707  peptidase M48, Ste24p  30.14 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0249991  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2815  peptidase M48, Ste24p  31.53 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5555  peptidase M56, BlaR1  36.92 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4513  peptidase M48, Ste24p  41.41 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3654  hypothetical protein  43.18 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5718  hypothetical protein  43.18 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.361083  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5290  hypothetical protein  43.18 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0721405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1442  hypothetical protein  44.32 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1460  hypothetical protein  44.32 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2594  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4245  peptidase M48 Ste24p  38.78 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2232  peptidase M48, Ste24p  41.3 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4744  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2620  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2852  peptidase M48, Ste24p  35.88 
 
 
318 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4516  peptidase M48, Ste24p  31.28 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552731  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0897  hypothetical protein  43.18 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  44.68 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  35.71 
 
 
453 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  38.46 
 
 
331 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  29.23 
 
 
328 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  32.14 
 
 
429 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7011  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.804082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  40.43 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  32.14 
 
 
419 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  32.14 
 
 
429 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5279  peptidase M48 Ste24p  43.75 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  42.11 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  32.14 
 
 
419 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2565  hypothetical protein  26.88 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768992  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  32.14 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  40.98 
 
 
422 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  30.95 
 
 
419 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  36.07 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  27.73 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  32.14 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  38.6 
 
 
453 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  36.21 
 
 
416 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  29.76 
 
 
427 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  33.33 
 
 
434 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  24.22 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  30.95 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4281  hypothetical protein  31.63 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  32.14 
 
 
421 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  30.95 
 
 
419 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  37.7 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  30.95 
 
 
469 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  30.95 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  30.95 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  36.07 
 
 
417 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  32.91 
 
 
419 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  32.91 
 
 
422 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1383  heat shock protein HtpX  24.07 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  31.65 
 
 
324 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  37.7 
 
 
421 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  37.7 
 
 
419 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  37.7 
 
 
421 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  37.7 
 
 
421 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  37.7 
 
 
419 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  37.7 
 
 
419 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  37.7 
 
 
421 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0724  K+-transporting ATPase, B subunit  33.54 
 
 
704 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>