More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1036 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  78.28 
 
 
419 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  85.27 
 
 
421 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  94.03 
 
 
419 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  85.68 
 
 
419 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  85.68 
 
 
419 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  85.68 
 
 
419 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  96.66 
 
 
419 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  97.85 
 
 
419 aa  784    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  85.27 
 
 
421 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  100 
 
 
419 aa  843    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  85.27 
 
 
421 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  85.61 
 
 
419 aa  687    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  81.38 
 
 
419 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  99.76 
 
 
419 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  96.66 
 
 
419 aa  799    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  85.27 
 
 
421 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  99.76 
 
 
419 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  80.91 
 
 
419 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  68.18 
 
 
469 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  68.84 
 
 
427 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  59.85 
 
 
417 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  57.91 
 
 
417 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  58.6 
 
 
429 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  64.41 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  63.7 
 
 
422 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  58.89 
 
 
437 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  58.65 
 
 
437 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  64.58 
 
 
418 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  59.71 
 
 
421 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  59.81 
 
 
429 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  56.5 
 
 
427 aa  472  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  62.78 
 
 
425 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  54.85 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  56.2 
 
 
418 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  58.1 
 
 
675 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  60.86 
 
 
422 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  59.06 
 
 
453 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  55.16 
 
 
416 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  54.61 
 
 
428 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  51.34 
 
 
453 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  49.39 
 
 
415 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  53.36 
 
 
434 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  50.24 
 
 
418 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  43.51 
 
 
414 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  41.41 
 
 
410 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  42.32 
 
 
414 aa  276  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  37.31 
 
 
412 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  37.06 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 
400 aa  248  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  38.39 
 
 
411 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  34.76 
 
 
421 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  38.39 
 
 
416 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  40.83 
 
 
422 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  37.15 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  36.83 
 
 
419 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  37.47 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  38.88 
 
 
416 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  37.68 
 
 
420 aa  242  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  34 
 
 
399 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  33.01 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  35.66 
 
 
419 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  37.19 
 
 
419 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  35.45 
 
 
422 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  37.03 
 
 
421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  39.34 
 
 
418 aa  233  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  34.94 
 
 
424 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  31.36 
 
 
406 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  33.25 
 
 
408 aa  230  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  33.25 
 
 
404 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  33 
 
 
395 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  36.1 
 
 
428 aa  229  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  32.76 
 
 
395 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  32.35 
 
 
395 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  36.01 
 
 
415 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  33.51 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  36.45 
 
 
464 aa  212  9e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  33.51 
 
 
414 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  34.65 
 
 
413 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  36.24 
 
 
395 aa  206  9e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  36.49 
 
 
427 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  37.96 
 
 
421 aa  203  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  41.22 
 
 
410 aa  203  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  32.32 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  33.16 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.498357 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  35.97 
 
 
456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  36.69 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  30.22 
 
 
452 aa  196  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  33.33 
 
 
433 aa  195  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  29.23 
 
 
406 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63669  predicted protein  29.34 
 
 
452 aa  170  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000327085 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33410  predicted protein  35.16 
 
 
345 aa  169  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.841869  normal  0.225834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  29.32 
 
 
413 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  33.03 
 
 
410 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  31.72 
 
 
405 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  31.02 
 
 
375 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  29.55 
 
 
397 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  32.03 
 
 
392 aa  149  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  29.95 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  26.08 
 
 
440 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1231  Ste24 endopeptidase  28.18 
 
 
392 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>