273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0524 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  100 
 
 
417 aa  843    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  89.45 
 
 
417 aa  771    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  59.18 
 
 
419 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  59.42 
 
 
419 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  59.85 
 
 
419 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  59.85 
 
 
419 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  59.85 
 
 
419 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  58.6 
 
 
419 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  58.35 
 
 
419 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  57.28 
 
 
419 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  59.52 
 
 
419 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  59.52 
 
 
419 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  59.52 
 
 
419 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  59.52 
 
 
419 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  59.23 
 
 
421 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  59.23 
 
 
421 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  59.37 
 
 
419 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  59.23 
 
 
421 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  58.6 
 
 
419 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  59.23 
 
 
421 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  59.76 
 
 
427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  58.59 
 
 
437 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  57.11 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  58.59 
 
 
437 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  58.15 
 
 
469 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  58.21 
 
 
421 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  56.97 
 
 
429 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  57.38 
 
 
675 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  60.58 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  59.27 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  59.27 
 
 
419 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  52.06 
 
 
427 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  60.31 
 
 
425 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  50.96 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  50.36 
 
 
418 aa  408  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  57.63 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  50 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  53.28 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  55.2 
 
 
453 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  51.97 
 
 
428 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  54.68 
 
 
434 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  48.56 
 
 
415 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  50.73 
 
 
418 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  42.23 
 
 
414 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  42.39 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  43.37 
 
 
414 aa  282  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  37.65 
 
 
399 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  36.06 
 
 
419 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  35.66 
 
 
419 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  36.34 
 
 
400 aa  246  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  36.5 
 
 
422 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  36.84 
 
 
416 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  36.84 
 
 
411 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  36.1 
 
 
421 aa  239  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  35.02 
 
 
425 aa  236  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  36.34 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  35.02 
 
 
421 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  35.79 
 
 
399 aa  229  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  36.59 
 
 
416 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  40.31 
 
 
418 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  37.56 
 
 
422 aa  228  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  34.49 
 
 
395 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  32.85 
 
 
404 aa  227  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  34 
 
 
395 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  35.16 
 
 
412 aa  225  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  37.92 
 
 
415 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  33.89 
 
 
452 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  34.5 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  33.9 
 
 
408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  32.46 
 
 
424 aa  222  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  31.97 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  34.01 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  34.43 
 
 
406 aa  209  8e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  37.63 
 
 
419 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  33.26 
 
 
464 aa  206  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  34.68 
 
 
456 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  32.53 
 
 
435 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  40.07 
 
 
411 aa  202  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  33.95 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  39.2 
 
 
428 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  42.03 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  31.73 
 
 
395 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  32.92 
 
 
433 aa  197  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  36.01 
 
 
413 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  34.65 
 
 
460 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  37.95 
 
 
421 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  34.72 
 
 
415 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  38.83 
 
 
418 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63669  predicted protein  31.93 
 
 
452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000327085 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33410  predicted protein  35.24 
 
 
345 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.841869  normal  0.225834 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  30.67 
 
 
406 aa  156  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  30.03 
 
 
392 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  29.58 
 
 
389 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  29.58 
 
 
397 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1231  Ste24 endopeptidase  26.36 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  28.91 
 
 
375 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  27.7 
 
 
405 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1885  Ste24 endopeptidase  28.38 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  27.12 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  27.68 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>