282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0883 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  89.18 
 
 		 418 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  100 
 
 		 422 aa  854    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  97.39 
 
 		 419 aa  754    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  70.15 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  68.99 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  64.42 
 
 		 419 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  63.94 
 
 		 419 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  63.22 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  63.94 
 
 		 419 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  63.46 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  63.46 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  63.7 
 
 		 419 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  61.54 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  63.94 
 
 		 419 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  62.98 
 
 		 419 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  63.83 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  63.37 
 
 		 421 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  63.37 
 
 		 421 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  63.37 
 
 		 421 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  63.37 
 
 		 421 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  63.2 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  63.2 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  63.2 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  59.12 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  58.37 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  56.59 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  57.25 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  56.06 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  57.71 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  57.14 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  55.81 
 
 		 437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  53.27 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  55.31 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  56.49 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  58.38 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  58.31 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  57.63 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  54.63 
 
 		 675 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  50.37 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  54.96 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  49.76 
 
 		 415 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  53.96 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  48.8 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  42.96 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  41.96 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  43.13 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  38.42 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  38.42 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  39.16 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  38.42 
 
 		 419 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  38.42 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  38.01 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  36.43 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  33.73 
 
 		 404 aa  239  8e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  36.32 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  36.89 
 
 		 420 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  40.29 
 
 		 422 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  33.65 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  34.51 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  35.57 
 
 		 404 aa  233  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  37.86 
 
 		 399 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  36.06 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  37.18 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  34.92 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  39.07 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  31.5 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  31.54 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  29.9 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  31.62 
 
 		 395 aa  217  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  35 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  38.82 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  34.6 
 
 		 414 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  32.59 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  34.13 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  34.3 
 
 		 421 aa  209  8e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  34.2 
 
 		 415 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  38.41 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  36.81 
 
 		 413 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  31.25 
 
 		 433 aa  206  9e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  32.45 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  34.55 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  34.52 
 
 		 428 aa  202  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  34.67 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  33.25 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  36.23 
 
 		 410 aa  192  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33410  predicted protein  35.28 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.841869  normal  0.225834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  34.55 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  39.51 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63669  predicted protein  30.86 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000327085 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  29.95 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  30.52 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  32.68 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  31.08 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  30.49 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  31.25 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  31.27 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  31.7 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  30.19 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3074  Ste24 endopeptidase  30.99 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0228689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>