268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3217 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  100 
 
 
397 aa  795    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  58.29 
 
 
405 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  51.9 
 
 
407 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  46.77 
 
 
413 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  46 
 
 
410 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 
421 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  30.85 
 
 
375 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1177  peptidase, M48 family  28.82 
 
 
422 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4163  peptidase, M48 family  28.99 
 
 
422 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  30.03 
 
 
419 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  29.2 
 
 
419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1027  peptidase M48 Ste24p  28.08 
 
 
422 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1045  M48 family peptidase  28.08 
 
 
439 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1023  metalloprotease  28.08 
 
 
439 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1124  M48 family peptidase  28.08 
 
 
422 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1021  metalloprotease  28.08 
 
 
438 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.969299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1280  peptidase, M48 family  27.83 
 
 
421 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.870615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1223  M48 family peptidase  27.83 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.391151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1203  peptidase, M48 family  27.83 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.726235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3515  Ste24 endopeptidase  34.07 
 
 
419 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0848  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 
420 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  34.4 
 
 
425 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4877  Ste24 endopeptidase  34.56 
 
 
417 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.671838  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2694  integral membrane protease transmembrane protein  30.34 
 
 
425 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3074  Ste24 endopeptidase  33.91 
 
 
431 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0228689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  30.63 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
440 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  31.17 
 
 
420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3332  peptidase M48 Ste24p  34.16 
 
 
428 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  30.83 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  30.94 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  32.7 
 
 
395 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  29.2 
 
 
414 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3122  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
411 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  27.44 
 
 
406 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  33.33 
 
 
395 aa  153  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  31.41 
 
 
395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  31.53 
 
 
411 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  27.34 
 
 
418 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3283  Ste24 endopeptidase  31.43 
 
 
495 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  31.43 
 
 
395 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  30.18 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  27.42 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  33.97 
 
 
415 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  26.94 
 
 
427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  26.46 
 
 
452 aa  145  9e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  28.88 
 
 
406 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5542  Ste24 endopeptidase  26.03 
 
 
480 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  29.72 
 
 
419 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  29.87 
 
 
422 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  31.45 
 
 
429 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  32.71 
 
 
456 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  29.34 
 
 
419 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  31.35 
 
 
469 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  28.7 
 
 
399 aa  144  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  29.71 
 
 
419 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  29.18 
 
 
412 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  29.24 
 
 
419 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  29.18 
 
 
419 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  29.04 
 
 
419 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  29.04 
 
 
419 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  28.44 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  28.44 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  28.39 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4179  peptidase M48, Ste24p  31.74 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671172  normal  0.465034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  28.14 
 
 
419 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  31.31 
 
 
429 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  27.91 
 
 
417 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  29.58 
 
 
417 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  30.46 
 
 
421 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  26.93 
 
 
453 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  27.27 
 
 
415 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  30.6 
 
 
414 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  30 
 
 
421 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  30.32 
 
 
433 aa  138  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  26.6 
 
 
421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  30.3 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  28.03 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  29.26 
 
 
675 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  27.73 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  28.7 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  29.56 
 
 
418 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  27.67 
 
 
392 aa  133  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  27.47 
 
 
422 aa  133  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  26.63 
 
 
413 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  29.38 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  29.51 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  27.56 
 
 
418 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  26.11 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1231  Ste24 endopeptidase  24.13 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  28.71 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  28.01 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  29.43 
 
 
414 aa  131  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  27.76 
 
 
404 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  29.18 
 
 
399 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  28.34 
 
 
427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  28.44 
 
 
437 aa  130  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  29.27 
 
 
419 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  32.13 
 
 
453 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  27.1 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>