195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3122 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3122  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
411 aa  789    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2694  integral membrane protease transmembrane protein  45.08 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3074  Ste24 endopeptidase  43.95 
 
 
431 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0228689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3332  peptidase M48 Ste24p  47.3 
 
 
428 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3515  Ste24 endopeptidase  40.62 
 
 
419 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  32.56 
 
 
413 aa  207  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4877  Ste24 endopeptidase  43.62 
 
 
417 aa  205  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.671838  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  30.1 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3283  Ste24 endopeptidase  39.21 
 
 
495 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  30.22 
 
 
397 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  29.4 
 
 
407 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1885  Ste24 endopeptidase  35.98 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  28.28 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1027  peptidase M48 Ste24p  25.45 
 
 
422 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  27.02 
 
 
440 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1280  peptidase, M48 family  25 
 
 
421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.870615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1223  M48 family peptidase  24.94 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.391151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4163  peptidase, M48 family  25 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5542  Ste24 endopeptidase  32.84 
 
 
480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1177  peptidase, M48 family  24.75 
 
 
422 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1124  M48 family peptidase  27.02 
 
 
422 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1045  M48 family peptidase  24.75 
 
 
439 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1023  metalloprotease  24.75 
 
 
439 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1021  metalloprotease  24.68 
 
 
438 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.969299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1203  peptidase, M48 family  26.71 
 
 
421 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.726235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  31.81 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0848  peptidase M48 Ste24p  24.55 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  24.07 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  29.51 
 
 
404 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  29.14 
 
 
411 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  29.41 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  30.25 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  29.8 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4179  peptidase M48, Ste24p  31.37 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671172  normal  0.465034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1205  peptidase, M48 family  29.11 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  28.04 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  27.15 
 
 
399 aa  113  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  30.37 
 
 
421 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  30.97 
 
 
429 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  27.96 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  30.45 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  27.64 
 
 
464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1231  Ste24 endopeptidase  27.25 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  28.15 
 
 
410 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  26.13 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  29.49 
 
 
399 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  25.39 
 
 
421 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  23.77 
 
 
418 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  31.31 
 
 
414 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  30.68 
 
 
415 aa  106  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  34.82 
 
 
421 aa  106  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  31.9 
 
 
675 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  26.42 
 
 
419 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  28.69 
 
 
418 aa  104  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  25.64 
 
 
415 aa  103  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  29.17 
 
 
425 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  28.62 
 
 
417 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  23.47 
 
 
406 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  26.96 
 
 
417 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  26.8 
 
 
428 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 
400 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  33.19 
 
 
415 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  24.74 
 
 
422 aa  100  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  26.18 
 
 
420 aa  99.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  32.44 
 
 
413 aa  99.8  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  28.48 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  31.86 
 
 
404 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  24.83 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  27.78 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  29.9 
 
 
419 aa  97.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  25.81 
 
 
395 aa  96.3  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  28.94 
 
 
419 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  30.56 
 
 
419 aa  96.3  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  28.48 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  28.94 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  28.94 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  27.11 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  23.83 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  30.99 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  29.5 
 
 
437 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  22.73 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  28.09 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  28.09 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  29.36 
 
 
418 aa  94.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  29.44 
 
 
414 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2907  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
393 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0591989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  31.6 
 
 
453 aa  93.6  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  27.98 
 
 
419 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  32.2 
 
 
425 aa  92.8  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  31.5 
 
 
421 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  27.98 
 
 
419 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  30.27 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  27.92 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  29.32 
 
 
437 aa  92.8  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  32.43 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  24.11 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  32.72 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  32.43 
 
 
416 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  27.36 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  27.6 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>