More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0568 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 419 aa  842    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  92.84 
 
 		 419 aa  791    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  62.59 
 
 		 421 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  61.61 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  58.39 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  57.11 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  44.02 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  40 
 
 		 435 aa  299  7e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  41.55 
 
 		 422 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  39.31 
 
 		 416 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  40.29 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  39.3 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  39.04 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  39.04 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  40.82 
 
 		 675 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  36.93 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  39.55 
 
 		 414 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  39.7 
 
 		 469 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  35.9 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  37.86 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  38.15 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  38.27 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  35.66 
 
 		 417 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  36.93 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  36.8 
 
 		 453 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  36.3 
 
 		 422 aa  245  8e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  36.64 
 
 		 464 aa  246  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  35.7 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  36.48 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  39.1 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  38.7 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  35.97 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  36.71 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  37.18 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  35.8 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  35.68 
 
 		 416 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  36.67 
 
 		 415 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  36.14 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  36.14 
 
 		 419 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  35.9 
 
 		 419 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  35.9 
 
 		 419 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  37.44 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  35.66 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  34.84 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  36.63 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  37.44 
 
 		 418 aa  230  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  38.17 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  37.56 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  37.56 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  37.56 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  37.56 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  37.56 
 
 		 422 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  37.31 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  35.88 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  37.88 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  37.88 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  37.66 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  37.88 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  37.88 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  33.01 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  34.69 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  36.36 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  37.31 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  36.21 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  35.98 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  34.2 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  38.44 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  34.38 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  34.13 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  33.74 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  36.45 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  32.29 
 
 		 418 aa  206  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  33.75 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  32.76 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  36.59 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  33.59 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0205695 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  31.1 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  31.06 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  31.63 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  36 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  28.47 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  29.2 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  32.99 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  35.1 
 
 		 375 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  32.92 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  29.52 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  32.14 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  31.13 
 
 		 460 aa  176  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  32.43 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  31.73 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  28.12 
 
 		 410 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1045  M48 family peptidase  28.03 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1023  metalloprotease  28.03 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  29.2 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1021  metalloprotease  28.94 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.969299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1124  M48 family peptidase  28.03 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1203  peptidase, M48 family  28.68 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.726235 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  27.88 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  31.49 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>