More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3283 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3515  Ste24 endopeptidase  91.41 
 
 
419 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3283  Ste24 endopeptidase  100 
 
 
495 aa  955    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4877  Ste24 endopeptidase  59.44 
 
 
417 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.671838  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2694  integral membrane protease transmembrane protein  48.36 
 
 
425 aa  312  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3074  Ste24 endopeptidase  49.52 
 
 
431 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0228689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3332  peptidase M48 Ste24p  52.83 
 
 
428 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1885  Ste24 endopeptidase  44.74 
 
 
398 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3122  peptidase M48, Ste24p  39.8 
 
 
411 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  38.19 
 
 
375 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  32.79 
 
 
413 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  30.83 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5542  Ste24 endopeptidase  33.33 
 
 
480 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  30.53 
 
 
407 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  30.18 
 
 
405 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  28.85 
 
 
410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  32.63 
 
 
419 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1045  M48 family peptidase  27.17 
 
 
439 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1023  metalloprotease  27.17 
 
 
439 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  30.83 
 
 
389 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1280  peptidase, M48 family  27.19 
 
 
421 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.870615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1021  metalloprotease  26.73 
 
 
438 aa  157  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.969299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  32.71 
 
 
421 aa  156  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1124  M48 family peptidase  26.96 
 
 
422 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  31.67 
 
 
419 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1223  M48 family peptidase  26.73 
 
 
421 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.391151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
440 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1203  peptidase, M48 family  26.96 
 
 
421 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.726235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  32.95 
 
 
414 aa  153  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1231  Ste24 endopeptidase  27.65 
 
 
392 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  34.25 
 
 
420 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1027  peptidase M48 Ste24p  25.58 
 
 
422 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1177  peptidase, M48 family  25.58 
 
 
422 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4163  peptidase, M48 family  25.81 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0848  peptidase M48 Ste24p  28.04 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  32.31 
 
 
424 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  30.97 
 
 
408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  29.66 
 
 
392 aa  144  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  34.88 
 
 
416 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1205  peptidase, M48 family  30.56 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  34.8 
 
 
411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  26.14 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  32.3 
 
 
427 aa  140  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  33.61 
 
 
437 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  28.72 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  33.8 
 
 
437 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  31.86 
 
 
435 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  31.55 
 
 
425 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  30.74 
 
 
429 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  33.22 
 
 
416 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  31.44 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  32.48 
 
 
469 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4179  peptidase M48, Ste24p  27.58 
 
 
427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671172  normal  0.465034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  30.74 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  28.28 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  31.11 
 
 
675 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  27.86 
 
 
406 aa  131  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  31.8 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  29.17 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  24.69 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  29.24 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  28.76 
 
 
428 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  32.78 
 
 
415 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  24.69 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  25 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  30.28 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  30.48 
 
 
419 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  30.7 
 
 
419 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  25.74 
 
 
422 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  29.77 
 
 
419 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  26.74 
 
 
417 aa  124  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  28.21 
 
 
433 aa  124  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  33.64 
 
 
422 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  32.25 
 
 
421 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  29.77 
 
 
419 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  29.77 
 
 
419 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  28.03 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  26.46 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  29.22 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  25.72 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  30.34 
 
 
453 aa  121  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  29.53 
 
 
419 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0005  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  28.66 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  31.74 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2907  peptidase M48 Ste24p  27.48 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0591989 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  27.6 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  34.46 
 
 
422 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  29.23 
 
 
429 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  33.12 
 
 
413 aa  120  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  33.44 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  30.92 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  29.94 
 
 
419 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  24.56 
 
 
395 aa  118  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  31.31 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  29.13 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  29.02 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  27.03 
 
 
417 aa  117  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  26.97 
 
 
415 aa  117  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  29.81 
 
 
418 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  29.46 
 
 
419 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>