164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1205 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  80.61 
 
 		 392 aa  646    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1205  peptidase, M48 family  100 
 
 		 392 aa  794    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1231  Ste24 endopeptidase  83.93 
 
 		 392 aa  677    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  34.51 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  31.78 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  28.73 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  33.23 
 
 		 421 aa  166  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  28.94 
 
 		 424 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5542  Ste24 endopeptidase  34.27 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  27.12 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  27.72 
 
 		 419 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2694  integral membrane protease transmembrane protein  31.44 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  28.26 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  29.35 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  26.22 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  30.33 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3515  Ste24 endopeptidase  30.75 
 
 		 419 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  29.16 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  30.43 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  29.5 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  28.57 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  27.63 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1885  Ste24 endopeptidase  33.81 
 
 		 398 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  28.57 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  26.5 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  28.71 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  27.1 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4877  Ste24 endopeptidase  30.66 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  26.08 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  25 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  28.46 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  30.07 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  27.37 
 
 		 419 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  29.28 
 
 		 460 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  27.37 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  27.37 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  26.76 
 
 		 435 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  27.11 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  26.93 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  27.11 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  26.7 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  26.74 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  27.84 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  27.3 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  28.38 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  26.47 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  29.33 
 
 		 404 aa  135  9e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  25.74 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  26.67 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  28.11 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  26.06 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  25.78 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  27.42 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  28 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  28.66 
 
 		 420 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  24.4 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  28.33 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  27.1 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  27.82 
 
 		 675 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  25.86 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  25.26 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  25 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3074  Ste24 endopeptidase  31.56 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0228689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  27.4 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3283  Ste24 endopeptidase  29.78 
 
 		 495 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  25.71 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  24.79 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  26.58 
 
 		 464 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2907  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0591989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  26.58 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  27.82 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  24.6 
 
 		 429 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  25.21 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  25.46 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  28.37 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  27.64 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  30.52 
 
 		 418 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  28.69 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  28.69 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  28.69 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  28.69 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  25.26 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3332  peptidase M48 Ste24p  30.5 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  27.55 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  27.55 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  27.55 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  27.37 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4179  peptidase M48, Ste24p  27.69 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671172  normal  0.465034 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  23.32 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  25.88 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  25.28 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  28.93 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  24.75 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  30.98 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  27.03 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  26.76 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0848  peptidase M48 Ste24p  24.84 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>