157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63669 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63669  predicted protein  100 
 
 
452 aa  913    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000327085 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33410  predicted protein  90.17 
 
 
345 aa  630  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.841869  normal  0.225834 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  50.33 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  41.98 
 
 
456 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  38.08 
 
 
460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  33.73 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  31.6 
 
 
417 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  31.93 
 
 
417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  30.3 
 
 
427 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  37.35 
 
 
411 aa  177  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  30.84 
 
 
427 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  31.9 
 
 
429 aa  176  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  31.73 
 
 
429 aa  176  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  30.27 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  29.21 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  30.7 
 
 
422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  30.66 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  30.32 
 
 
419 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  30.63 
 
 
414 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  30.77 
 
 
418 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  30.47 
 
 
422 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  30.17 
 
 
437 aa  172  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  29.93 
 
 
435 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  30.07 
 
 
419 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  30.22 
 
 
419 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  30.17 
 
 
424 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  29.23 
 
 
419 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  37.84 
 
 
412 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  30.69 
 
 
453 aa  169  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  29.95 
 
 
418 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  28.29 
 
 
418 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  28.99 
 
 
419 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  27.92 
 
 
428 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  30.31 
 
 
453 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  29.93 
 
 
437 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
400 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  29.34 
 
 
419 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  29.34 
 
 
419 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  29.34 
 
 
419 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  31.44 
 
 
421 aa  167  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  29.86 
 
 
425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  31.99 
 
 
422 aa  166  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  28.74 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  29.01 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  29.83 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  30.15 
 
 
419 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  31.23 
 
 
404 aa  163  6e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  34.23 
 
 
399 aa  163  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  30.28 
 
 
418 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  35.53 
 
 
425 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  29.06 
 
 
421 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  28.54 
 
 
421 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  28.54 
 
 
421 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  28.54 
 
 
421 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  28.54 
 
 
421 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  28.92 
 
 
419 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  32.49 
 
 
418 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  28.92 
 
 
419 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  28.92 
 
 
419 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  35.43 
 
 
415 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  28.95 
 
 
675 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  31.44 
 
 
433 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  27.12 
 
 
416 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  28.61 
 
 
422 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  30.75 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  27.32 
 
 
411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  27.61 
 
 
416 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  30.03 
 
 
413 aa  153  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  31.03 
 
 
419 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  27.85 
 
 
420 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  28.6 
 
 
419 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  29.32 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  26.35 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  27.64 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  32.6 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  27.82 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  29.03 
 
 
395 aa  144  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  32.13 
 
 
428 aa  144  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  29.6 
 
 
434 aa  144  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  27.88 
 
 
415 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  29.1 
 
 
399 aa  142  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  30.93 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  28.57 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  30.89 
 
 
406 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  27.9 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  27.9 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  27.52 
 
 
395 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  28.67 
 
 
408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  26.72 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3217  Ste24 endopeptidase  29.43 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  26.22 
 
 
413 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1403  Ste24 endopeptidase  29.23 
 
 
410 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000815793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  26.96 
 
 
406 aa  106  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  24.92 
 
 
405 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  27.11 
 
 
389 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  26.64 
 
 
392 aa  100  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  25.81 
 
 
407 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  24.4 
 
 
375 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2585  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 
440 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00439089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>