More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1428 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  100 
 
 		 439 aa  853    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  51.91 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  50.79 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  52.6 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  51.23 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  53.52 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  51.45 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  51.48 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  51.25 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  47.13 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  47.37 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  46.96 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  45.32 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1201  peptidase M50  48.01 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.436201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  43.98 
 
 		 451 aa  346  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  44.59 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  42.23 
 
 		 453 aa  328  9e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2184  peptidase M50  42.44 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0212322  hitchhiker  0.00132975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1500  peptidase M50  49.65 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  34.56 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3574  peptidase M50  37.27 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  35.43 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1351  peptidase M50  35.43 
 
 		 416 aa  220  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09990  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  36.55 
 
 		 402 aa  220  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.417947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1169  peptidase M50  37.27 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  34.77 
 
 		 403 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2118  peptidase M50  34.69 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12885  transmembrane protein  35.06 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.769587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2261  peptidase M50  32.82 
 
 		 412 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7761  peptidase M50  31.43 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4082  peptidase M50  33.85 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.331426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2043  metallopeptidase MEROPS family protein  32 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2026  metallopeptidase MEROPS family protein  32 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456946  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2089  metallopeptidase MEROPS family protein  32 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.468771  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3371  peptidase M50  35.48 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1683  peptidase M50  32.1 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  32.43 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  27.85 
 
 		 347 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.7 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.24 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  32.34 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.67 
 
 		 345 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.02 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  30.07 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  28.71 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  30.54 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.76 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  25.64 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.35 
 
 		 347 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.94 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  28.16 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  30.03 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.04 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  28.16 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  28.69 
 
 		 351 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  28.69 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  27.93 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.86 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.69 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.49 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  25.52 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  25.13 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  27.24 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  23.67 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.23 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  26.21 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  26.2 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.32 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  27.4 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  25.23 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  27.81 
 
 		 355 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.45 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  26.42 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  31.84 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  24.83 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  32.07 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  27.61 
 
 		 373 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.91 
 
 		 561 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.44 
 
 		 383 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.87 
 
 		 366 aa  106  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  27.51 
 
 		 396 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3509  peptidase M50  27.54 
 
 		 363 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.042901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  26.42 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  34.3 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  26.02 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  26.65 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  29.6 
 
 		 561 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  30.35 
 
 		 561 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  25.65 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  25.5 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.06 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.06 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  23.62 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.17 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.97 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  26.83 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>