More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1125 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  100 
 
 
585 aa  1192    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  55.07 
 
 
547 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  56.19 
 
 
552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  54.04 
 
 
541 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  50.1 
 
 
586 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  48.61 
 
 
543 aa  491  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  47.09 
 
 
561 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  46.37 
 
 
542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  46.44 
 
 
546 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  45.12 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  59.13 
 
 
537 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  40.86 
 
 
560 aa  363  6e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  39.72 
 
 
533 aa  349  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  39.72 
 
 
534 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  39.21 
 
 
554 aa  347  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  39.88 
 
 
541 aa  342  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  36.38 
 
 
522 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 
543 aa  310  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  36.64 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  37.4 
 
 
552 aa  303  8.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  35.95 
 
 
543 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 
543 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.28 
 
 
543 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  36.42 
 
 
541 aa  293  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  33.52 
 
 
537 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  34.16 
 
 
527 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  31.42 
 
 
528 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  31.76 
 
 
536 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 
532 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.85 
 
 
536 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.72 
 
 
536 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.03 
 
 
543 aa  143  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.67 
 
 
536 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.67 
 
 
536 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
531 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
533 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
545 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.68 
 
 
536 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
529 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 
536 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.5 
 
 
536 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
536 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 
545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  28.08 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 
526 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 
549 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 
561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 
529 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  27.92 
 
 
530 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  24.67 
 
 
554 aa  126  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 
594 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  27.22 
 
 
529 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  25.66 
 
 
555 aa  124  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
526 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  24.86 
 
 
556 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  26.1 
 
 
545 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.52 
 
 
529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 
538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.09 
 
 
529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.16 
 
 
525 aa  118  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 
537 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 
544 aa  118  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  23 
 
 
530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2242  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
564 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 
535 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
541 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  23.98 
 
 
535 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  22.69 
 
 
530 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
539 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3591  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 
564 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.018176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3340  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 
564 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
525 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
535 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.96 
 
 
525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.23 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  22.49 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.23 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.23 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.23 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  26.23 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  24.13 
 
 
558 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 
556 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1952  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.44 
 
 
546 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  27.58 
 
 
535 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1873  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.66 
 
 
546 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000232622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  23.45 
 
 
535 aa  114  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3694  oligopeptide-binding protein OppA  24.27 
 
 
564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.308453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1917  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.81 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.445291  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  27.16 
 
 
535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  26 
 
 
538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>