180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0585 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  100 
 
 		 362 aa  739    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  75.21 
 
 		 360 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  59.72 
 
 		 357 aa  471  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  61.69 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  60.06 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  52.42 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  51.69 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  53.17 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  53.03 
 
 		 335 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  48.84 
 
 		 387 aa  332  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  44.74 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  48.17 
 
 		 339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  48.66 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  45.67 
 
 		 336 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  43.92 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  44.75 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  42.68 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  40.84 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  27.66 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3365  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 387 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.0569216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2247  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1916  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0311153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  20.83 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  25.64 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  23.03 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.39 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.46 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  30.77 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 		 715 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2881  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  24.71 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  21.05 
 
 		 667 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  25.13 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  28.48 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  25.87 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  25 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  27.81 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3734  putative dehydrogenase  27.7 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  22.78 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  24.6 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  28.74 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  24.13 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  28.86 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  23.75 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  28.19 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  28.19 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 		 373 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  28.19 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  28.19 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3885  oxidoreductase, NAD-binding  28.19 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  26.35 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>