134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0395 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 728 aa  1372    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.564778  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  35.16 
 
 		 759 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  37.71 
 
 		 695 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  37.02 
 
 		 631 aa  382  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  32.68 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  34.93 
 
 		 711 aa  349  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31.33 
 
 		 857 aa  324  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0282  YhgE/Pip C-terminal domain protein  36.96 
 
 		 702 aa  323  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 678 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6104  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  32.87 
 
 		 597 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 669 aa  317  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  35.16 
 
 		 678 aa  316  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0952  YhgE/Pip C-terminal domain protein  36.7 
 
 		 646 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0289849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0432  YhgE/Pip C-terminal domain protein  32.04 
 
 		 666 aa  310  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  29.12 
 
 		 769 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  27.63 
 
 		 797 aa  273  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 825 aa  272  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  29.19 
 
 		 666 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  28.76 
 
 		 663 aa  263  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 669 aa  260  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  28.47 
 
 		 666 aa  260  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  28.18 
 
 		 666 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  28.47 
 
 		 666 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  27.46 
 
 		 666 aa  257  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  27.04 
 
 		 666 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.07 
 
 		 737 aa  254  6e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  28.32 
 
 		 666 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  28.32 
 
 		 666 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  26.63 
 
 		 772 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.11 
 
 		 869 aa  239  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.11 
 
 		 869 aa  239  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  25.11 
 
 		 869 aa  238  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  24.86 
 
 		 869 aa  237  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  30.78 
 
 		 882 aa  232  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  33.99 
 
 		 683 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  30.08 
 
 		 785 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.38 
 
 		 782 aa  223  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  36.75 
 
 		 988 aa  218  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  25.53 
 
 		 721 aa  211  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  27.58 
 
 		 1111 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  24.31 
 
 		 772 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  28.32 
 
 		 1114 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.66 
 
 		 740 aa  190  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  26.65 
 
 		 911 aa  185  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 733 aa  185  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  26.03 
 
 		 915 aa  184  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  25.97 
 
 		 923 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  38.63 
 
 		 732 aa  181  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  26.57 
 
 		 924 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0180  hypothetical protein  25.75 
 
 		 754 aa  175  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1969  hypothetical protein  24.69 
 
 		 789 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  41.53 
 
 		 819 aa  174  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2594  phage infection protein, putative  22.78 
 
 		 721 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  27.45 
 
 		 512 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2916  putative phage infection protein  23.07 
 
 		 721 aa  168  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  33.27 
 
 		 946 aa  166  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0758  YhgE/Pip N-terminal domain protein  34.65 
 
 		 718 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26740  YhgE/Pip-like protein  33.17 
 
 		 823 aa  157  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  31.67 
 
 		 649 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1762  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23.71 
 
 		 723 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2593  phage infection protein, putative  22.18 
 
 		 718 aa  151  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2915  putative phage infection protein  22.28 
 
 		 718 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  23 
 
 		 876 aa  146  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1037 aa  144  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2510  YhgE/Pip N-terminal domain protein  24.89 
 
 		 705 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  24.23 
 
 		 887 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1247  hypothetical protein  24.97 
 
 		 720 aa  142  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1500  hypothetical protein  24.41 
 
 		 779 aa  140  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  24.4 
 
 		 958 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11010  YhgE/Pip-like protein  24.48 
 
 		 724 aa  139  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.659482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  26.09 
 
 		 954 aa  138  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 		 940 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06030  YhgE/Pip-like protein  24.97 
 
 		 967 aa  134  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.646381  normal  0.719714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  27.52 
 
 		 955 aa  133  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  23.22 
 
 		 991 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  23.45 
 
 		 953 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  26.7 
 
 		 876 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2667  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 993 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2723  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 993 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  23.5 
 
 		 981 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1462  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.71 
 
 		 728 aa  127  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  23.98 
 
 		 953 aa  126  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  23.59 
 
 		 953 aa  125  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4888  phage infection protein  23.63 
 
 		 953 aa  125  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108734  normal  0.760577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 981 aa  124  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  23.97 
 
 		 623 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  22.87 
 
 		 941 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  22.87 
 
 		 941 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  22.87 
 
 		 941 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0498  YhgE/Pip C-terminal domain protein  22.78 
 
 		 726 aa  110  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.325694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06020  YhgE/Pip-like protein  28.27 
 
 		 717 aa  95.1  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.333428  normal  0.219375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1461  YhgE/Pip C-terminal domain protein  26.59 
 
 		 881 aa  85.9  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  0.893103 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5391  phage infection protein  39.17 
 
 		 142 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  23.17 
 
 		 863 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  34.25 
 
 		 1068 aa  79  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1246 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  28.69 
 
 		 767 aa  75.5  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  21.14 
 
 		 1038 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  21.85 
 
 		 888 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  21.54 
 
 		 1038 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>