More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2065 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  83.47 
 
 		 376 aa  646    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  100 
 
 		 366 aa  743    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  80.11 
 
 		 371 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  79.36 
 
 		 374 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  74.26 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  69.52 
 
 		 375 aa  525  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  72.8 
 
 		 358 aa  524  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  67.91 
 
 		 375 aa  518  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  68.48 
 
 		 370 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  70.05 
 
 		 361 aa  501  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  70.33 
 
 		 360 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  68.66 
 
 		 365 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  69.78 
 
 		 363 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  66.39 
 
 		 364 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  65.21 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  65.56 
 
 		 364 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  65.22 
 
 		 370 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  66.67 
 
 		 359 aa  472  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  65.11 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  64.84 
 
 		 363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  63.19 
 
 		 360 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  63.36 
 
 		 356 aa  454  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  65.38 
 
 		 360 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.84 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  63.13 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  64.29 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  64.29 
 
 		 361 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  64.01 
 
 		 361 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  62.67 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  61.96 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  60 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  59.78 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  57.45 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  56.1 
 
 		 384 aa  391  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  58.91 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  52.53 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  52.3 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  52.3 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 		 369 aa  381  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.97 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  55.01 
 
 		 372 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  51.65 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  52.7 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  52.43 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  54.52 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  52.15 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  54.95 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.75 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 366 aa  371  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  54.95 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  53.91 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  53.17 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  52.65 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  54.95 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  49.87 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  49.73 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  50.25 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.13 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  52.88 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  51.46 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.46 
 
 		 380 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 370 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.57 
 
 		 374 aa  361  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  50.26 
 
 		 399 aa  361  9e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.92 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.51 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  53.12 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  52.19 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  54.55 
 
 		 370 aa  360  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.73 
 
 		 351 aa  359  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  49.61 
 
 		 405 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  49.61 
 
 		 405 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  53.87 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  52.91 
 
 		 393 aa  358  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3093  ABC transporter related  51.09 
 
 		 361 aa  358  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  51.19 
 
 		 372 aa  358  8e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  50.68 
 
 		 360 aa  358  9e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  49.75 
 
 		 410 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  51.32 
 
 		 371 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  54.4 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.79 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  52.99 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  49.35 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  51.16 
 
 		 388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  53.53 
 
 		 354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  50.38 
 
 		 405 aa  355  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  49.22 
 
 		 398 aa  355  5.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  50.81 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>