More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1678 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1678  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 355 aa  698    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.032246  hitchhiker  0.0057053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  50.14 
 
 		 341 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  48.43 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  45.48 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  45.59 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  47.69 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2308  thiamine-monophosphate kinase  47.49 
 
 		 327 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000127742  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  41.9 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  42.2 
 
 		 344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  42.32 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  43.6 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  39.83 
 
 		 370 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  42.98 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  47.12 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  41.9 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  48.6 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2789  thiamine-monophosphate kinase  47.32 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  0.0905665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  41.61 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4040  thiamine-monophosphate kinase  49.48 
 
 		 328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.139533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0643  thiamine monophosphate kinase  43.82 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  42.82 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  42.62 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1165  thiamine monophosphate kinase  46.73 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000347409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1275  thiamine monophosphate kinase  43.71 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532695  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2512  thiamine-monophosphate kinase  42.41 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2151  thiamine monophosphate kinase  43.81 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2249  thiamine-monophosphate kinase  43.21 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10790  thiamine-monophosphate kinase  40.64 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.322383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12992  thiamine monophosphate kinase  42.3 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000372497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3206  thiamine-monophosphate kinase  38.27 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  39.51 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2839  thiamine-monophosphate kinase  42.9 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1912  thiamine monophosphate kinase  42.21 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1932  thiamine monophosphate kinase  42.21 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1978  thiamine monophosphate kinase  42.21 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  30.97 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.36 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  32.49 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  35.41 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0088  thiamine monophosphate kinase  32.34 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  33.44 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  31.91 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 		 344 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  29.48 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1351  thiamine-phosphate kinase  29.7 
 
 		 327 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.41 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.94 
 
 		 346 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.41 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  31.09 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  28.96 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  38.52 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  34.68 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  32.11 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.41 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  32.2 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00231  putative thiamine-monophosphate kinase  29.08 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.44 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  29.94 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.86 
 
 		 324 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  24.44 
 
 		 320 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  29.93 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.71 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  31.7 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  34.15 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  30.29 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  33.54 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  27.8 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  34.15 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  34.15 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  34.15 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  31.1 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  27.7 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08710  thiamine-monophosphate kinase  32.05 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  27.67 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  28.38 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  32.39 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  32.39 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  29.68 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  30.86 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  29.17 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  31.29 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  32.39 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  29.77 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  32.04 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  26.9 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  30.88 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  27.86 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  26.42 
 
 		 273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  32.01 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>