More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1209 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  100 
 
 
584 aa  1169    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  50.34 
 
 
605 aa  529  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.85 
 
 
606 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
635 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
608 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  45.66 
 
 
610 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  44.5 
 
 
625 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  44.68 
 
 
602 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  41.44 
 
 
589 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  44.22 
 
 
613 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  43.85 
 
 
625 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  40.81 
 
 
671 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.66 
 
 
617 aa  415  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  42.76 
 
 
597 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  44.7 
 
 
638 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  40 
 
 
726 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  43.01 
 
 
591 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  45.56 
 
 
608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
609 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.4 
 
 
730 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.17 
 
 
581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  34.76 
 
 
984 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  27.73 
 
 
586 aa  240  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  29.11 
 
 
589 aa  239  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  27.05 
 
 
593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 
600 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  28.88 
 
 
582 aa  233  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  26.84 
 
 
571 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.84 
 
 
571 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.84 
 
 
571 aa  230  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.38 
 
 
1257 aa  229  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.83 
 
 
1284 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  26.29 
 
 
571 aa  228  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.65 
 
 
571 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.4 
 
 
585 aa  227  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.65 
 
 
571 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.65 
 
 
571 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.65 
 
 
571 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  31.77 
 
 
611 aa  226  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.65 
 
 
571 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  31.72 
 
 
636 aa  226  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.3 
 
 
587 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.53 
 
 
618 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.11 
 
 
593 aa  224  4e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  33.52 
 
 
631 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  29.71 
 
 
586 aa  224  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.22 
 
 
573 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.47 
 
 
571 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  25.14 
 
 
594 aa  223  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  29.07 
 
 
583 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  30.66 
 
 
589 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  29.32 
 
 
589 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  34.83 
 
 
1231 aa  220  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  25.82 
 
 
584 aa  220  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  28.98 
 
 
586 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  26.69 
 
 
583 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  26.7 
 
 
583 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  30.22 
 
 
579 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  27.6 
 
 
578 aa  219  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  28.8 
 
 
616 aa  218  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  30.88 
 
 
620 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  30.58 
 
 
578 aa  217  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  31.85 
 
 
640 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.69 
 
 
586 aa  216  5.9999999999999996e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.59 
 
 
622 aa  216  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  25.75 
 
 
593 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.03 
 
 
587 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  29.21 
 
 
583 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  31.33 
 
 
628 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.68 
 
 
579 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.69 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  32.02 
 
 
1522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.37 
 
 
585 aa  215  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.52 
 
 
583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  29.14 
 
 
577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  26.65 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.51 
 
 
577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  26.7 
 
 
586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  25.21 
 
 
591 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.22 
 
 
548 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.38 
 
 
597 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  29.18 
 
 
591 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  26.89 
 
 
572 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  28.37 
 
 
607 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  28.16 
 
 
587 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  30.46 
 
 
579 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  31.08 
 
 
580 aa  213  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.13 
 
 
614 aa  213  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.53 
 
 
581 aa  212  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  31.08 
 
 
619 aa  212  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  32.07 
 
 
577 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  28.85 
 
 
586 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  25 
 
 
606 aa  212  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  28.02 
 
 
572 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.52 
 
 
586 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.43 
 
 
595 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  27.79 
 
 
614 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  33.98 
 
 
589 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  23.64 
 
 
592 aa  212  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  31.12 
 
 
577 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>