More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0105 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
337 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4613  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.45 
 
 
340 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.714391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.26 
 
 
334 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  63.75 
 
 
339 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  62.84 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  55.56 
 
 
349 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  52.71 
 
 
333 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  54.3 
 
 
334 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  54.49 
 
 
335 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  52.52 
 
 
334 aa  362  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  53.55 
 
 
336 aa  356  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.33 
 
 
336 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  50.45 
 
 
332 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.05 
 
 
339 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.28 
 
 
346 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  51.49 
 
 
336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.4 
 
 
334 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  52.25 
 
 
341 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.34 
 
 
338 aa  332  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  48.5 
 
 
337 aa  330  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.85 
 
 
343 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 
331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 
331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  49.11 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.82 
 
 
337 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  46.55 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  46.45 
 
 
341 aa  305  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  49.25 
 
 
334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  47.29 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
331 aa  298  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.16 
 
 
336 aa  295  7e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 
332 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 
332 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 
332 aa  288  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.58 
 
 
334 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.55 
 
 
332 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  42.77 
 
 
331 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0585  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.36 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
339 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  40.29 
 
 
343 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1058  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.73 
 
 
340 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  41.84 
 
 
334 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.83 
 
 
335 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  40.53 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3099  hypothetical protein  39.12 
 
 
345 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.216129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43190  oxidoreductase  40.65 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.449372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0294  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.24 
 
 
338 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36290  hypothetical protein  39.41 
 
 
345 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.24 
 
 
344 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25100  predicted NADP-dependent oxidoreductase  40.99 
 
 
340 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3736  alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
339 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0347646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2992  alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
344 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 
334 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.39 
 
 
345 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  40 
 
 
345 aa  248  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2132  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.92 
 
 
338 aa  248  8e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.82 
 
 
337 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.39 
 
 
337 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  38.62 
 
 
332 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 
346 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1012  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.36 
 
 
349 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  38.69 
 
 
337 aa  245  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0862  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.99 
 
 
335 aa  245  9e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2197  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.4 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2055  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.4 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1603  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.81 
 
 
340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  0.326802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6849  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.87 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0954432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3348  alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
347 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  0.442758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1387  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
341 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.9 
 
 
345 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.88 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.1 
 
 
345 aa  243  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.1 
 
 
345 aa  242  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  39.1 
 
 
345 aa  242  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4195  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.17 
 
 
334 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0909  alcohol dehydrogenase  39.82 
 
 
330 aa  242  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1719  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  38.81 
 
 
345 aa  241  9e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  38.81 
 
 
345 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  38.81 
 
 
345 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
333 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
341 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
333 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1704  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  37.83 
 
 
345 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1571  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  37.83 
 
 
345 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.332785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1769  putative NADP-dependent oxidoreductase Yncb  37.83 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1707  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  37.83 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.24259  normal  0.344049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1752  putative NADP-dependent oxidoreductase yncb  37.83 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  38.92 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  39.58 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0804  alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.17 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
333 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
337 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3312  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.65 
 
 
342 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001313  putative NADP-dependent oxidoreductase  37.61 
 
 
344 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  38.17 
 
 
336 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  37.82 
 
 
342 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  39.47 
 
 
340 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>