More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1240 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  297  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  78.81 
 
 
152 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 
152 aa  236  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  77.48 
 
 
152 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  77.48 
 
 
152 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  76.16 
 
 
152 aa  229  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  74.15 
 
 
153 aa  227  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.75 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 
155 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
180 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
159 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
156 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  36.36 
 
 
156 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
155 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
156 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 
157 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  42.97 
 
 
166 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  42.97 
 
 
165 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
154 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  42.97 
 
 
166 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
156 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
155 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 
156 aa  97.1  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
163 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 
158 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2104  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  35.81 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  42.19 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  42.19 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
174 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  42.19 
 
 
167 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
188 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 
155 aa  94.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  35.82 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5249  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
166 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.615663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
164 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.92 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0652  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
168 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  38.41 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
163 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
153 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
174 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  34.46 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>