More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2104 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2104  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1388  transcriptional regulator, AsnC family  60.78 
 
 		 153 aa  191  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3088  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0410  AsnC family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  46.36 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 169 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  44.97 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  44.97 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  44.97 
 
 		 162 aa  143  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 178 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  48.67 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  48.67 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  48.67 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  48.67 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  48.67 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.39 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1253  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.28 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  42.38 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 169 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 198 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1151  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.872906  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 282 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 198 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.1 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  46.81 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  44.08 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 195 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0468  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.674302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2377  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.830552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>