More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5359 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5359  histidine kinase  100 
 
 		 408 aa  810    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2640  histidine kinase  31.18 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.976353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 1207 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 953 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 944 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  30.04 
 
 		 531 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 679 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 799 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.72 
 
 		 1303 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 639 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 920 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 597 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 639 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 945 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 639 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 591 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 463 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 1344 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  30.86 
 
 		 1003 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  31.84 
 
 		 1015 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 932 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 656 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 526 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.770795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  35.51 
 
 		 469 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 601 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 666 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 666 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 601 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4472  PAS  33.48 
 
 		 679 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  30.86 
 
 		 927 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 540 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 839 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 770 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 641 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 654 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  30.9 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 600 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 835 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1014 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 625 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  33.81 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 720 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3379  histidine kinase  28.27 
 
 		 626 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2724  histidine kinase  28.27 
 
 		 626 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.61 
 
 		 1348 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 733 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 672 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 597 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  31.56 
 
 		 656 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 933 aa  99.8  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  29.78 
 
 		 539 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  32.29 
 
 		 527 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  28.18 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.19 
 
 		 496 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  31.51 
 
 		 598 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  29.15 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 458 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 885 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 810 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0175  histidine kinase  30.43 
 
 		 231 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 774 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  31.68 
 
 		 676 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5449  histidine kinase  29.81 
 
 		 542 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 902 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.39 
 
 		 631 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 576 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 477 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 781 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 801 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 646 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5994  histidine kinase  31.58 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0285375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 1223 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  33.95 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 640 aa  97.4  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 597 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 664 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 477 aa  97.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 614 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0027  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 739 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  30.74 
 
 		 993 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 686 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 533 aa  96.7  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 758 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 475 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>