More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2573 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
733 aa  1442    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.03 
 
 
593 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.86 
 
 
555 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 
612 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  22.42 
 
 
586 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.73 
 
 
577 aa  150  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 
566 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
588 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
592 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  29.93 
 
 
595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  28.92 
 
 
596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  27.38 
 
 
595 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  27.68 
 
 
595 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  28.02 
 
 
595 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
593 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  28.07 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
597 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
612 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
489 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
597 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
585 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 
577 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
591 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
799 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  32.29 
 
 
506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  26.48 
 
 
581 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
554 aa  120  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  32.53 
 
 
554 aa  120  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
587 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
587 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
953 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
582 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.5 
 
 
470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
827 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  37.83 
 
 
885 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
591 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
588 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
625 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 
609 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  35.82 
 
 
549 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
399 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  33.87 
 
 
591 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  33.87 
 
 
591 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
888 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
594 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
874 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 
608 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  33.87 
 
 
591 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
534 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  33.07 
 
 
591 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
829 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 
604 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
387 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  35 
 
 
591 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  33.87 
 
 
591 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.01 
 
 
1629 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
933 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
608 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
839 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
412 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  33.87 
 
 
591 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
408 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  33.87 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
1039 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  33.07 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  33.87 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  35.53 
 
 
741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
408 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  26.18 
 
 
581 aa  112  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  35.83 
 
 
502 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
359 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 
624 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
965 aa  112  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
448 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  31.95 
 
 
914 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.11 
 
 
1371 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
412 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
556 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
640 aa  111  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
620 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
718 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
493 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
556 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
592 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
572 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  31.3 
 
 
617 aa  110  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
819 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  31.42 
 
 
584 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1207 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
639 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  29.6 
 
 
565 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
412 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 
581 aa  109  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
590 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>