More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3460 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3460  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 469 aa  939    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.617969  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3788  ABC transporter, inner membrane subunit  27.59 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0136936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  34.04 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3931  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.597389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3845  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  32.61 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  28.71 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.82 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  26.61 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  33.09 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.11 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  30.46 
 
 		 1090 aa  67  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  27.14 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  35.11 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  35.38 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  38.64 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.25 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.64 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  26.32 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  36.09 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  30.71 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.5 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  33.09 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  29.6 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  30.85 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  35.11 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  34.01 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  30.41 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  38.28 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  32.21 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.33 
 
 		 649 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  29.08 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  31.63 
 
 		 394 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  34.35 
 
 		 663 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  31.29 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  33.85 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.49 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  30.38 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  32.92 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  32.37 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  27.59 
 
 		 650 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.93 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.76 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.59 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30.32 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  31.89 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  27.41 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.65 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  31.29 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  31.29 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.8 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  29.94 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  33.33 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.16 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  31.94 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  34.38 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.66 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  35.14 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  22.83 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.26 
 
 		 665 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  29.93 
 
 		 1130 aa  60.5  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  33.59 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  30.22 
 
 		 903 aa  60.1  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  33.1 
 
 		 919 aa  60.1  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  34.72 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30.77 
 
 		 843 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  33.88 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.23 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.85 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  23.24 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.75 
 
 		 640 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.65 
 
 		 648 aa  60.1  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  34.23 
 
 		 654 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.72 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  25.4 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30.56 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 		 873 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  24.38 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  29.81 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.48 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30.56 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.59 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  35.07 
 
 		 861 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  28.04 
 
 		 678 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.95 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  35.61 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  28.04 
 
 		 678 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.41 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  28.86 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>