132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0983 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  100 
 
 
1147 aa  2340    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0988  hypothetical protein  47.78 
 
 
990 aa  592  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318965  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.21 
 
 
941 aa  268  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  41.55 
 
 
544 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  36.16 
 
 
1187 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.96 
 
 
817 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  38.69 
 
 
1207 aa  234  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.5 
 
 
787 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  38.83 
 
 
778 aa  201  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.29 
 
 
784 aa  195  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.47 
 
 
837 aa  192  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  34.27 
 
 
792 aa  192  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  37.01 
 
 
776 aa  187  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.74 
 
 
535 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  32.28 
 
 
447 aa  179  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  36.8 
 
 
389 aa  173  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  48.88 
 
 
651 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  34.91 
 
 
454 aa  168  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  36.54 
 
 
602 aa  161  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.97 
 
 
553 aa  154  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4489  hypothetical protein  51.83 
 
 
319 aa  149  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488935  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  29.76 
 
 
449 aa  146  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1678  hypothetical protein  48.12 
 
 
940 aa  143  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507171  hitchhiker  0.000632186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 
556 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  33.23 
 
 
618 aa  135  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.36 
 
 
818 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.03 
 
 
821 aa  128  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.5 
 
 
551 aa  126  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.48 
 
 
593 aa  125  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.69 
 
 
554 aa  125  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  32.82 
 
 
376 aa  125  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1406  hypothetical protein  56.07 
 
 
396 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332746  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.32 
 
 
1848 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  31.07 
 
 
553 aa  119  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.48 
 
 
810 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  31.14 
 
 
403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3634  hypothetical protein  51.89 
 
 
482 aa  117  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  hitchhiker  0.000640384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.14 
 
 
417 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  35.61 
 
 
569 aa  116  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  34.57 
 
 
326 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.63 
 
 
558 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  32.4 
 
 
579 aa  115  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  31.61 
 
 
558 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  31.28 
 
 
341 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.53 
 
 
561 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  32.03 
 
 
477 aa  111  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.69 
 
 
546 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.35 
 
 
570 aa  109  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  30.96 
 
 
743 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3071  PKD domain containing protein  27.5 
 
 
1067 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192813  normal  0.491387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.11 
 
 
555 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
745 aa  105  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.09 
 
 
567 aa  104  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  29.77 
 
 
577 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.26 
 
 
1919 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  28.07 
 
 
2082 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.75 
 
 
563 aa  100  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.82 
 
 
900 aa  100  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  29.11 
 
 
638 aa  99.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  28.35 
 
 
418 aa  99.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.3 
 
 
555 aa  99.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  29.07 
 
 
566 aa  98.2  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.67 
 
 
469 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  30.75 
 
 
681 aa  97.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  35.42 
 
 
560 aa  95.1  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.36 
 
 
737 aa  93.2  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  28.72 
 
 
554 aa  93.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  26.7 
 
 
911 aa  93.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.57 
 
 
443 aa  92.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.76 
 
 
454 aa  91.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  29.14 
 
 
835 aa  88.2  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  28.13 
 
 
461 aa  87.4  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  29.04 
 
 
1129 aa  87  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.65 
 
 
706 aa  85.1  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  28.96 
 
 
726 aa  84.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  25.17 
 
 
714 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  27.95 
 
 
461 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.46 
 
 
1679 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  27.25 
 
 
717 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.18 
 
 
807 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  80.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  30.72 
 
 
328 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  26.6 
 
 
643 aa  79.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  32.14 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  28.57 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  32.66 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  26.74 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  24.56 
 
 
14609 aa  76.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  24.6 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  25 
 
 
727 aa  73.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  26.3 
 
 
1222 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02874  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 
1365 aa  71.2  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.46357 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  26.28 
 
 
375 aa  71.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  25.31 
 
 
547 aa  71.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1506  hypothetical protein  48.53 
 
 
367 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00662762  hitchhiker  0.0000622749 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.57 
 
 
643 aa  70.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  28.76 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  27.11 
 
 
399 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  22.81 
 
 
499 aa  66.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  26.91 
 
 
547 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>