More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0351 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
549 aa  1089    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.68 
 
 
561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  35.51 
 
 
561 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  35.63 
 
 
561 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.48 
 
 
558 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  34.34 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  37.06 
 
 
453 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  38.64 
 
 
446 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  35.12 
 
 
452 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.12 
 
 
452 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.65 
 
 
355 aa  156  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.35 
 
 
455 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40.41 
 
 
454 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.1 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  36.79 
 
 
354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.22 
 
 
377 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  36.79 
 
 
354 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  39.5 
 
 
354 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.45 
 
 
455 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  38.6 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  36.97 
 
 
355 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.25 
 
 
455 aa  146  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  33.23 
 
 
450 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.96 
 
 
480 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2843  membrane-associated zinc metalloprotease  38.81 
 
 
491 aa  143  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.72 
 
 
448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.78 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  38.6 
 
 
356 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.22 
 
 
372 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  34.25 
 
 
453 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  38.94 
 
 
396 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.33 
 
 
450 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.33 
 
 
452 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.11 
 
 
450 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.58 
 
 
454 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  35.94 
 
 
450 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.09 
 
 
451 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.4 
 
 
355 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3363  peptidase M50  33.24 
 
 
681 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.35 
 
 
450 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  34.75 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  36.4 
 
 
454 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.76 
 
 
355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.94 
 
 
354 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.66 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  36.33 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  34.4 
 
 
463 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  33.45 
 
 
450 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  35.09 
 
 
456 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  34.33 
 
 
453 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  34.82 
 
 
380 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  35.4 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.4 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.37 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  32.92 
 
 
454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.05 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.36 
 
 
457 aa  131  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  32.31 
 
 
461 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.55 
 
 
456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  32.32 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.59 
 
 
456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  33.2 
 
 
456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0344  hypothetical protein  25.86 
 
 
619 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  33.98 
 
 
456 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  33.98 
 
 
456 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.99 
 
 
455 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  28.73 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  33.6 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  30.34 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  33.59 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  35.21 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  30.69 
 
 
494 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  37.17 
 
 
347 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.06 
 
 
456 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.93 
 
 
380 aa  127  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.42 
 
 
456 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  34.34 
 
 
446 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.84 
 
 
450 aa  127  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.2 
 
 
456 aa  127  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
453 aa  126  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.6 
 
 
495 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  35.45 
 
 
496 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0037  peptidase M50  24.02 
 
 
501 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  34.63 
 
 
454 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0037  peptidase M50  24.02 
 
 
501 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.69 
 
 
454 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  36.11 
 
 
448 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.08 
 
 
456 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.68 
 
 
456 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  33.06 
 
 
466 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1972  hypothetical protein  33.33 
 
 
453 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.31127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31 
 
 
453 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  34.53 
 
 
383 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  32.16 
 
 
452 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  28.41 
 
 
452 aa  124  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  28.83 
 
 
452 aa  124  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  31.6 
 
 
451 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.97 
 
 
461 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.42 
 
 
339 aa  123  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  33.98 
 
 
469 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>