More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2057 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2057  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  100 
 
 		 324 aa  660    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  42.39 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 934 aa  178  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.76 
 
 		 931 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 928 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 928 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 928 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 928 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 928 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.87 
 
 		 929 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  36.95 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  35.59 
 
 		 928 aa  173  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 928 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 928 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0697  5'-3' exonuclease  38.97 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 930 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 930 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  35.92 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 934 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  35.59 
 
 		 929 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  34.46 
 
 		 930 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 916 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  35.17 
 
 		 484 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04579  exodeoxyribonuclease IX  36.4 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 932 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 932 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 932 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.83 
 
 		 926 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  33.9 
 
 		 938 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  34.53 
 
 		 922 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 912 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 951 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 922 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 891 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  35.45 
 
 		 934 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 922 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2376  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  38.26 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  34.2 
 
 		 922 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  33.98 
 
 		 933 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 973 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  35.64 
 
 		 922 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  35.53 
 
 		 903 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 906 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 928 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 928 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  35.74 
 
 		 1273 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 930 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  34.87 
 
 		 903 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  32.75 
 
 		 941 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 945 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  34.34 
 
 		 937 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  36.26 
 
 		 482 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 937 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 937 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  36.57 
 
 		 902 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 992 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  39.33 
 
 		 928 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  34.21 
 
 		 903 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  39.85 
 
 		 899 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  34.42 
 
 		 924 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  39.85 
 
 		 899 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  35.82 
 
 		 892 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  34.66 
 
 		 935 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 829 aa  156  5.0000000000000005e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  34.53 
 
 		 899 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  34.91 
 
 		 921 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  36.74 
 
 		 939 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  34.91 
 
 		 921 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  34.91 
 
 		 921 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  34.04 
 
 		 940 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  34.28 
 
 		 979 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  35.45 
 
 		 892 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 943 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  34.35 
 
 		 924 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 918 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 888 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  33.91 
 
 		 299 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  34.34 
 
 		 921 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3602  5'-3' exonuclease  36.82 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.94 
 
 		 903 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  34.83 
 
 		 879 aa  152  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  33.21 
 
 		 861 aa  152  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  34.59 
 
 		 978 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  34.71 
 
 		 903 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 904 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  33.67 
 
 		 474 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  31.53 
 
 		 944 aa  152  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 978 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  33.79 
 
 		 893 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 999 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 879 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  34.59 
 
 		 979 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 1016 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  34.17 
 
 		 946 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>