More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0297 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
239 aa  494  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  53.78 
 
 
230 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  53.78 
 
 
230 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  53.33 
 
 
242 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  52.23 
 
 
232 aa  236  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  52.44 
 
 
361 aa  231  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  49.56 
 
 
229 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  49.56 
 
 
229 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  51.11 
 
 
233 aa  228  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  49.59 
 
 
245 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  50 
 
 
230 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  48.29 
 
 
248 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0043  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53286  normal  0.734232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1704  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 
232 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000162863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  47.13 
 
 
357 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 
356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  49.78 
 
 
356 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 
356 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 
356 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  48.29 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  47.11 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  48.28 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  46.7 
 
 
229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  51.11 
 
 
239 aa  211  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  47.32 
 
 
344 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  50.22 
 
 
356 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 
356 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 
356 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  48.21 
 
 
345 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.78 
 
 
357 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  44.74 
 
 
233 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  46.67 
 
 
228 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  45.78 
 
 
249 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  45.98 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2270  beta-lactamase domain protein  45.53 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000611229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2644  metallo-beta-lactamase family protein  45.53 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  46.93 
 
 
250 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  45.09 
 
 
346 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1960  beta-lactamase domain protein  46.09 
 
 
250 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353249  normal  0.907481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  45.61 
 
 
250 aa  198  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  45.33 
 
 
249 aa  197  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  44.12 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  45.54 
 
 
233 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  45.54 
 
 
233 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16707  glyoxalase  46.05 
 
 
229 aa  186  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  42.27 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  41.82 
 
 
235 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.86 
 
 
346 aa  141  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  37.21 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  35.36 
 
 
266 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2821  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  hitchhiker  0.0000107542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 
297 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2604  protein of unknown function DUF442  32.82 
 
 
426 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148627  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2276  protein of unknown function DUF442  31.37 
 
 
426 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  31.58 
 
 
431 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2239  hypothetical protein  32.03 
 
 
288 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  32.03 
 
 
288 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  33.08 
 
 
432 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1405  beta-lactamase domain-containing protein  44.03 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.46 
 
 
439 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1610  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
296 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0776893  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.75 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1618  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 
296 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015165  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0068  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
294 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  hitchhiker  0.0000286033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0068  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0830  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1619  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0052  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000616686 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 
202 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3647  beta-lactamase-like  31.8 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  32.71 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 
214 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
289 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1686  Beta-lactamase-like  30.6 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0379  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
246 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1669  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
289 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46910  Beta-lactamase-like protein  32.33 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1515  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0071  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62064  hitchhiker  0.00000010593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4844  beta-lactamase-like  30.74 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0362  beta-lactamase-like  32.72 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000661224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  32.35 
 
 
294 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1071  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
244 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0956  metallo-beta-lactamase family protein  30.7 
 
 
291 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0369  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 
298 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
301 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  30.51 
 
 
294 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 
251 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.73 
 
 
233 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
303 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0295  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 
288 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0958  beta-lactamase domain-containing protein  32.33 
 
 
289 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2517  hypothetical protein  31.05 
 
 
294 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0472872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>