53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0016 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 159 aa  317  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  42.28 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  41.46 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  41.61 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  37.86 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  31.72 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  41.86 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  34.97 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  31.37 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  34.31 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  31.37 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  38.35 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  29.17 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  41.54 
 
 		 216 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  34.09 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  49.12 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  49.12 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  32.14 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  28.66 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  29.33 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  33.57 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  32.98 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  27.65 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  37.88 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  26.76 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  36.21 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  36.21 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  57.14 
 
 		 219 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  35.63 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  47.83 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  31.48 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  28.57 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  26.83 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  38.57 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  36.19 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  38.82 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  27.91 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  26.9 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  52.38 
 
 		 215 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  27.87 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  35.24 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  32.88 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  40 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3174  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  29.6 
 
 		 151 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  38.64 
 
 		 237 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0216  hypothetical protein  37.74 
 
 		 551 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.590946  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  32.43 
 
 		 202 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  32.84 
 
 		 195 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0490  methylation  41.54 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  32.73 
 
 		 880 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>