More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2797 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  54.15 
 
 
243 aa  257  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  39.57 
 
 
256 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  31.92 
 
 
287 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  26.72 
 
 
279 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 
520 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 
405 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29.73 
 
 
318 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 
373 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  32.16 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  31.09 
 
 
511 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  29.11 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  31.72 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  36.07 
 
 
359 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  28.94 
 
 
512 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  31.71 
 
 
316 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.78 
 
 
316 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.34 
 
 
362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  32.77 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  28.88 
 
 
513 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  28.46 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  28.88 
 
 
513 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 
324 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  27.91 
 
 
521 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  28.45 
 
 
513 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  29.31 
 
 
513 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  27.86 
 
 
528 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0642  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.439468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  28.24 
 
 
524 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  29.06 
 
 
408 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  28.9 
 
 
524 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
308 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  31.17 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  29.65 
 
 
351 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 
518 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 
279 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  27.76 
 
 
513 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  29.31 
 
 
281 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  30.04 
 
 
518 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 
279 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 
385 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 
518 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.47 
 
 
314 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 
320 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  31.49 
 
 
294 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 
519 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  26.58 
 
 
370 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 
367 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  28.26 
 
 
518 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  27.04 
 
 
523 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  26.02 
 
 
279 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  29.01 
 
 
315 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  30.83 
 
 
311 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  29.18 
 
 
378 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  29.17 
 
 
292 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
375 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
374 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  31.53 
 
 
288 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  29.46 
 
 
285 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  29.46 
 
 
285 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  28.19 
 
 
343 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  26.46 
 
 
387 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
320 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 
330 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  28.42 
 
 
557 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
320 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1910  cytochrome c oxidase, subunit II  29.46 
 
 
334 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  33.52 
 
 
362 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
401 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
401 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.23 
 
 
380 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 
374 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 
285 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 
285 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  29.13 
 
 
398 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  29.15 
 
 
285 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 
390 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 
544 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  30.41 
 
 
350 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  28.51 
 
 
435 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  28.31 
 
 
384 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  32.95 
 
 
362 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  27.23 
 
 
316 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  32.2 
 
 
269 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  29.38 
 
 
350 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  29.38 
 
 
350 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  28.94 
 
 
355 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 
328 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  29.22 
 
 
422 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  26.69 
 
 
288 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 
310 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.95 
 
 
311 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  28.22 
 
 
525 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  27.23 
 
 
375 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  28.22 
 
 
525 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  28.22 
 
 
525 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  28.22 
 
 
525 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  29.5 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  29.06 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>