More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0946 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  100 
 
 
366 aa  738    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  60.16 
 
 
382 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  57.69 
 
 
373 aa  395  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  55.38 
 
 
379 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  57.1 
 
 
364 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  55.31 
 
 
372 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  56.71 
 
 
383 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  54.74 
 
 
370 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  54.59 
 
 
378 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1150  ABC transporter related protein  55.52 
 
 
379 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.883021  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
377 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  52.29 
 
 
380 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
374 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  56.1 
 
 
381 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  52.5 
 
 
363 aa  369  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  52.39 
 
 
375 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  50.54 
 
 
370 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  51.58 
 
 
379 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.31 
 
 
380 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.06 
 
 
351 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  51.36 
 
 
369 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  53.15 
 
 
384 aa  364  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  51.75 
 
 
367 aa  364  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  51.75 
 
 
367 aa  364  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  49.18 
 
 
371 aa  363  4e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.73 
 
 
374 aa  361  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.97 
 
 
368 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  51.62 
 
 
381 aa  359  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.13 
 
 
372 aa  360  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.66 
 
 
367 aa  359  5e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.1 
 
 
367 aa  358  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  51.38 
 
 
365 aa  358  8e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  53.3 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  52.6 
 
 
364 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  54.7 
 
 
373 aa  355  5.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.02 
 
 
367 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  52 
 
 
375 aa  355  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
395 aa  355  6.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.87 
 
 
379 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.14 
 
 
366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50.14 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  52.42 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  52.09 
 
 
353 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49 
 
 
426 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 
366 aa  352  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  51.78 
 
 
366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  47.9 
 
 
405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  52.59 
 
 
364 aa  351  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  51.58 
 
 
395 aa  351  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.86 
 
 
366 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.19 
 
 
376 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
366 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  52.35 
 
 
360 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1816  ABC transporter related protein  54.89 
 
 
390 aa  350  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.15 
 
 
370 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  47.65 
 
 
405 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  47.65 
 
 
405 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 
365 aa  349  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  49.18 
 
 
366 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 
361 aa  349  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  55.36 
 
 
359 aa  349  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  50.14 
 
 
360 aa  349  5e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.73 
 
 
366 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.27 
 
 
366 aa  349  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.73 
 
 
367 aa  348  1e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  52.08 
 
 
361 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  49.07 
 
 
380 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  48.91 
 
 
369 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
370 aa  346  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.1 
 
 
355 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  49.73 
 
 
366 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 
351 aa  345  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.07 
 
 
362 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.3 
 
 
388 aa  345  6e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  49.32 
 
 
360 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
406 aa  345  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.44 
 
 
349 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  52.25 
 
 
361 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  49.47 
 
 
374 aa  345  8.999999999999999e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
409 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.68 
 
 
370 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  50.13 
 
 
376 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.8 
 
 
357 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  50.41 
 
 
357 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.41 
 
 
370 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  52.62 
 
 
363 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  51.11 
 
 
360 aa  343  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  52.17 
 
 
368 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  51.25 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  48.77 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.21 
 
 
351 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  48.64 
 
 
369 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 
349 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>