More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0841 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
358 aa  712    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.25 
 
 
356 aa  408  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  60 
 
 
371 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.54 
 
 
359 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.54 
 
 
386 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.99 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.7 
 
 
382 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  34.96 
 
 
360 aa  196  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  35.63 
 
 
361 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.3 
 
 
381 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  35.46 
 
 
334 aa  192  8e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  35.68 
 
 
375 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.34 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36 
 
 
343 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.44 
 
 
330 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  36.83 
 
 
403 aa  175  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.62 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  29.57 
 
 
404 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.25 
 
 
392 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  29.57 
 
 
404 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  29.03 
 
 
404 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  29.84 
 
 
403 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.6 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  29.49 
 
 
404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  35.62 
 
 
414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  34.68 
 
 
405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.28 
 
 
357 aa  163  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  31.66 
 
 
405 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  31.83 
 
 
399 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  33.6 
 
 
401 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  34.15 
 
 
403 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  32.04 
 
 
401 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  32.98 
 
 
422 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  32.28 
 
 
414 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.52 
 
 
391 aa  153  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  29.46 
 
 
416 aa  152  7e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  32.18 
 
 
401 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  30.59 
 
 
454 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  30.83 
 
 
423 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  29.57 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.5 
 
 
408 aa  146  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  29.49 
 
 
437 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  32.08 
 
 
419 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  32.1 
 
 
432 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  28.02 
 
 
373 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  31.79 
 
 
441 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  29.26 
 
 
434 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  32.1 
 
 
432 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.59 
 
 
430 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  30.24 
 
 
408 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  31.93 
 
 
419 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  32.44 
 
 
459 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  29.1 
 
 
441 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  29.38 
 
 
422 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  33.08 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  30.86 
 
 
437 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  28.99 
 
 
412 aa  137  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  28.16 
 
 
421 aa  136  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  32.33 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  33.02 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  30.03 
 
 
408 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  31.42 
 
 
394 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  32.02 
 
 
428 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  29.21 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  31.02 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  31.6 
 
 
416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  31.25 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.62 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  32.92 
 
 
425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  34.48 
 
 
402 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  33.33 
 
 
425 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  31.95 
 
 
396 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  32.39 
 
 
406 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  30.4 
 
 
403 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  33.6 
 
 
424 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  32.21 
 
 
429 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  30.73 
 
 
428 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  35.94 
 
 
356 aa  123  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  29.68 
 
 
411 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  28.62 
 
 
368 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  35.26 
 
 
426 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  30.16 
 
 
349 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  31.4 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  30.13 
 
 
351 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  28.62 
 
 
368 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  29.79 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  28.61 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  31.46 
 
 
331 aa  119  9e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  32.24 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  32.9 
 
 
347 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  31.45 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  32.39 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  32.61 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  31.13 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  31.87 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  31.76 
 
 
368 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  27.76 
 
 
367 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  34.08 
 
 
346 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  30.82 
 
 
363 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  33.76 
 
 
346 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>