286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0468 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
348 aa  676    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  55.09 
 
 
340 aa  335  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  55.82 
 
 
329 aa  322  9.000000000000001e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  51.52 
 
 
330 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 
318 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
324 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 
324 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  32.15 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
339 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  25.72 
 
 
310 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
332 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
337 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
324 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.89 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  24.76 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 
322 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 
368 aa  92.8  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.81 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25.07 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  30.3 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.76 
 
 
346 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  27.55 
 
 
317 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.86 
 
 
317 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
317 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  30.41 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  27.19 
 
 
317 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  27.19 
 
 
317 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
317 aa  86.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
321 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.56 
 
 
317 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  30.3 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  27.19 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  25.08 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  24.84 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 
862 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  24.28 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  26.48 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  27.14 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  25.72 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  28.53 
 
 
303 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  27.63 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  26.8 
 
 
358 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 
328 aa  63.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  25.62 
 
 
307 aa  63.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 
304 aa  63.2  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  28.53 
 
 
349 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.57 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  27.61 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  27.22 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  25.34 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  26.05 
 
 
306 aa  59.7  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
344 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  26.05 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.66 
 
 
213 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  26.85 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  23.38 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  33.75 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>