74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1941 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  46.79 
 
 
157 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  43.59 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  43.59 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  39.49 
 
 
156 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  40.62 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  42.95 
 
 
155 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  35.58 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  40.52 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  40.52 
 
 
162 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  40.26 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  40.51 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  39.84 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  39.17 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  39.87 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  33.77 
 
 
157 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  37.72 
 
 
163 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  36.08 
 
 
151 aa  97.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  36.08 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  34.62 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  33.12 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  33.12 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  32.73 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  32.69 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  44.55 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  35.76 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  39.81 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  32.8 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1521  sulfur oxidation protein SoxY  34.76 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  36.11 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2058  sulfur oxidation protein  36.94 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000379196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  32 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  37.23 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  36.28 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  31.33 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  32.81 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  37.93 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4960  sulfur oxidation protein SoxY  34.71 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3917  sulfur oxidation protein SoxY  42.55 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.326737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4157  sulfur oxidation protein SoxY  32.08 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  34.38 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  34.59 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  28.12 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  29.77 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4255  sulfur oxidation protein SoxY  36.89 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11078  normal  0.239592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4371  sulfur oxidation protein SoxY  36.89 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  30 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2806  sulfur oxidation protein SoxY  41.49 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.283582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3672  sulfur oxidation protein SoxY  40 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316792  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4151  sulfur oxidation protein SoxY  37.23 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2997  thiosulfate-binding protein SoxY  36.55 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000764918  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1470  hypothetical protein  32.58 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2763  sulfur oxidation protein SoxY  36.73 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2579  hypothetical protein  31.54 
 
 
264 aa  55.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.262093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2590  hypothetical protein  32.98 
 
 
268 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5984  Sulphur oxidation protein SoxZ  36 
 
 
266 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1248  hypothetical protein  31.18 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1777  sulphur oxidation protein SoxZ  37.11 
 
 
288 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0268772  normal  0.263513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1933  secreted protein-like protein  31.91 
 
 
268 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7669  sulfur oxidation protein SoxY  25.48 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3949  sulphur oxidation protein SoxZ  30.85 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  33.33 
 
 
302 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3185  sulphur oxidation protein SoxZ  25.32 
 
 
276 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  34.29 
 
 
302 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5759  sulphur oxidation protein SoxZ  32.99 
 
 
269 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356001  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6957  sulfur oxidation protein SoxY  24.84 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2188  hypothetical protein  31.36 
 
 
283 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.327297  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  30.85 
 
 
271 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0065  sulfur oxidation protein SoxY  30.61 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0471  hypothetical protein  32.14 
 
 
266 aa  41.2  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  27.62 
 
 
255 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>