46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0008 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  100 
 
 
145 aa  298  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  49.66 
 
 
145 aa  150  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  49.66 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  43.94 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  39.84 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  35.43 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  36.6 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  35.86 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  35.17 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  33.33 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  35.62 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  34.93 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  34 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  34 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  35.54 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  35.54 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 
161 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  34.71 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  35.95 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  32.03 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  31.61 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  33.99 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  29.87 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  34.45 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  35.53 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  29.69 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  32.23 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  38.95 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3782  hypothetical protein  38.24 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  29.05 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  32.48 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0516  sulfur oxidation protein SoxY  28.57 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000407688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1681  thiosulfate-binding protein SoxY  26.83 
 
 
155 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3044  secreted protein-like protein  27.73 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.906276  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  34.04 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3716  thiosulfate-binding protein SoxY  28.08 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00143807  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  27.78 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1908  thiosulfate-binding protein SoxY  28.97 
 
 
163 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695588  normal  0.0814173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2105  conserved hypothetical membrane associated protein  28.04 
 
 
302 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178772  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2499  conserved hypothetical membrane associated protein  28.04 
 
 
302 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  28.38 
 
 
258 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2818  hypothetical protein  25.49 
 
 
271 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>