39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0008 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  100 
 
 		 156 aa  322  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0009  thiosulfate-binding protein SoxY  60 
 
 		 145 aa  184  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.616931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0029  thiosulfate-binding protein SoxY  56.69 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0008  thiosulfate-binding protein SoxY  49.66 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479994  hitchhiker  0.00586011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0566  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  34.88 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000123827  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1036  twin-arginine translocation pathway signal  33.11 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.851465  normal  0.608263 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0803  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0603  sulfur oxidation protein SoxY-like  29.41 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3423  twin-arginine translocation pathway signal  29.8 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3255  twin-arginine translocation pathway signal  29.8 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0037  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  31.61 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2221  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  31.61 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.558685  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2072  sulfur oxidation protein SoxY-like protein  28.48 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1941  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0123  transmembrane proetin, twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1923  twin-arginine translocation pathway signal  29.37 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.921102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3457  hypothetical protein  30.67 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3129  hypothetical protein  30.67 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2284  hypothetical protein  30.32 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0560175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1667  hypothetical protein  30.32 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.90923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3259  hypothetical protein  27.52 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0812  twin-arginine translocation pathway signal  29.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000529367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1591  hypothetical protein  29.68 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3132  hypothetical protein  24.68 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0376986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2857  sulfur oxidation protein SoxY  28.1 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3091  hypothetical protein  28.76 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3675  sulfur oxidation protein  28.68 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.570689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0696  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  28.57 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3455  sulfur oxidation protein SoxZ  27.81 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1987  sulfur compound-chelating protein SoxY  32.63 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0145  sulfur oxidation protein precursor SoxY domain-containing protein  28.1 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2629  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1258  sulfur covalently-binding protein  32.22 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1668  hypothetical protein  30.53 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.615495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0261  thiosulfate-binding protein SoxY  24.36 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00586003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2677  hypothetical protein  25.26 
 
 		 255 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2436  thiosulfate-binding protein SoxY  25.17 
 
 		 156 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3126  hypothetical protein  24.21 
 
 		 253 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121178  normal  0.557372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3086  hypothetical protein  24.21 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>