More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0321 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  63.64 
 
 		 167 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  40.21 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  40.21 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  40.21 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  40.21 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  50 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  32.28 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  31.61 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  39.33 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  36.22 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  36.08 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  50.94 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  35.56 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  50.91 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  40 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  28.57 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  52.83 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  52.83 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  54.72 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  52.83 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  35.64 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  50 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  55.81 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  38.46 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  42.5 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  50 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  49.06 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  50 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  50 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  37.33 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  52.83 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  35.21 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  50.94 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  37.76 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.24 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  48.15 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  50 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  38.03 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  45.76 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  51.11 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  50 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  40.98 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  50 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  41.18 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  51.92 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  50.94 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  36.49 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  36.49 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  36.49 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  32.65 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  36.49 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  50 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  52.83 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  50.94 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  50 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  46.43 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  44.12 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  34.38 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  50 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  48.98 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  50.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  36.49 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  56.41 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  55 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  41.43 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  62.16 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  46.77 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  49.06 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  55.56 
 
 		 132 aa  52.4  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  57.89 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  33.8 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  42.11 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  31.13 
 
 		 114 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  56.41 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  46.3 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  34.78 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  37.31 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  29.06 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  56.76 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  35.87 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.08 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  52.17 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  28.7 
 
 		 141 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  37.31 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  56.76 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  51.22 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  52.5 
 
 		 138 aa  51.2  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  32.32 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  56.76 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3100  hypothetical protein  64.52 
 
 		 136 aa  51.2  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  56.76 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  29.75 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>