More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2748 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3549  ABC transporter related  55.43 
 
 
614 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2748  ABC transporter related  100 
 
 
595 aa  1199    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2272  ABC transporter related  53.77 
 
 
613 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11915  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3581  ABC transporter related  51.69 
 
 
599 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.689947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  49.74 
 
 
582 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  35.92 
 
 
581 aa  334  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  37.45 
 
 
588 aa  328  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  40.34 
 
 
588 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  36.49 
 
 
581 aa  323  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  40.97 
 
 
641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.99 
 
 
596 aa  317  5e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  34.86 
 
 
577 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.78 
 
 
598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  37.25 
 
 
589 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  34.68 
 
 
587 aa  312  9e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.16 
 
 
587 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  39.72 
 
 
601 aa  309  9e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.52 
 
 
606 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.17 
 
 
580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  36.16 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.85 
 
 
598 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.85 
 
 
588 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.1 
 
 
575 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  36.59 
 
 
594 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  34.98 
 
 
579 aa  300  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  37.5 
 
 
578 aa  299  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.88 
 
 
581 aa  299  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.25 
 
 
580 aa  299  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.14 
 
 
597 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.59 
 
 
556 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  36.46 
 
 
579 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  33.22 
 
 
594 aa  293  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.84 
 
 
578 aa  293  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.84 
 
 
578 aa  293  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.85 
 
 
644 aa  293  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  33.1 
 
 
597 aa  293  8e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.04 
 
 
597 aa  293  9e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.67 
 
 
600 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  36.01 
 
 
612 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  39.69 
 
 
642 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  36.42 
 
 
594 aa  291  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  36.58 
 
 
581 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  35.56 
 
 
603 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  32.79 
 
 
585 aa  290  5.0000000000000004e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.07 
 
 
572 aa  290  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.87 
 
 
617 aa  289  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33.6 
 
 
586 aa  289  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.13 
 
 
573 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  33.33 
 
 
566 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
566 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.13 
 
 
586 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  30.51 
 
 
584 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.61 
 
 
578 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.42 
 
 
584 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 
586 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.2 
 
 
586 aa  286  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.2 
 
 
586 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  35.34 
 
 
582 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.96 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33 
 
 
586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  33.9 
 
 
636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  34.98 
 
 
610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33 
 
 
586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.98 
 
 
609 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33 
 
 
586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  33.92 
 
 
603 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.98 
 
 
582 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.17 
 
 
597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.17 
 
 
597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  34.91 
 
 
582 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.93 
 
 
586 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  34.13 
 
 
575 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
577 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  34.3 
 
 
596 aa  283  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  31.87 
 
 
592 aa  283  7.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  34.61 
 
 
620 aa  283  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  34.31 
 
 
603 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.11 
 
 
591 aa  282  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.54 
 
 
583 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.75 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  34.79 
 
 
615 aa  281  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  31.47 
 
 
614 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  34.17 
 
 
577 aa  281  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.41 
 
 
586 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.8 
 
 
586 aa  280  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.65 
 
 
650 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.3 
 
 
572 aa  280  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  33.87 
 
 
604 aa  279  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  33.33 
 
 
583 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.33 
 
 
583 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.74 
 
 
586 aa  279  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
583 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  33.61 
 
 
583 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.21 
 
 
610 aa  279  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  33.33 
 
 
583 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.44 
 
 
575 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.12 
 
 
583 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3720  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
583 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.47 
 
 
589 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  35.41 
 
 
582 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>