48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0921 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  816    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  23.93 
 
 
367 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  27.1 
 
 
1171 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  27.3 
 
 
1177 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  25.91 
 
 
736 aa  86.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  25.3 
 
 
719 aa  80.1  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  30.23 
 
 
715 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  22.85 
 
 
741 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  23.26 
 
 
711 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  27.23 
 
 
720 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  31.28 
 
 
702 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  25.39 
 
 
1124 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  31.28 
 
 
701 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  29.93 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  27.57 
 
 
844 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  27.57 
 
 
847 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  27.57 
 
 
847 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  29.9 
 
 
715 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  32.62 
 
 
703 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  29.35 
 
 
720 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  32.52 
 
 
709 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  29.85 
 
 
698 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  32.63 
 
 
707 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  28.95 
 
 
709 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  33.81 
 
 
688 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  29.41 
 
 
715 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  30.89 
 
 
709 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  34.3 
 
 
238 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  35.66 
 
 
497 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  26.37 
 
 
474 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  31.75 
 
 
714 aa  63.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  29.47 
 
 
699 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  28.43 
 
 
720 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  24.85 
 
 
697 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  32 
 
 
701 aa  60.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  23.24 
 
 
696 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  25.67 
 
 
350 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  32.86 
 
 
701 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  25.46 
 
 
838 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  33.81 
 
 
825 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  24.04 
 
 
761 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  23.93 
 
 
721 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  26.15 
 
 
714 aa  53.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  24.04 
 
 
948 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4021  hypothetical protein  23.51 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  24.45 
 
 
824 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  26.9 
 
 
715 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2265  hypothetical protein  22.86 
 
 
413 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>