240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0364 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0603  degV family protein  57.45 
 
 
282 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0882391  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3520  degV family protein  56.38 
 
 
282 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350959  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3640  degV family protein  54.26 
 
 
284 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00084182  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  36.59 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  38.27 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  37.91 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  37.18 
 
 
279 aa  209  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  36.4 
 
 
281 aa  209  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  38.99 
 
 
282 aa  208  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  36.23 
 
 
279 aa  208  9e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  36.53 
 
 
279 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  35.66 
 
 
280 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  35.77 
 
 
280 aa  204  9e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  36.23 
 
 
279 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  36.03 
 
 
279 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  35.66 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  32.85 
 
 
281 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  35.32 
 
 
277 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  31.05 
 
 
281 aa  181  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  35.61 
 
 
311 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  31.37 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  35.97 
 
 
311 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.17 
 
 
279 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  34.89 
 
 
310 aa  178  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  36.75 
 
 
281 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  39.57 
 
 
282 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  32.5 
 
 
282 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.87 
 
 
299 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  34.03 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  33.1 
 
 
285 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  34.29 
 
 
287 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  30.25 
 
 
283 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0602  degV family protein  32.74 
 
 
281 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  28.67 
 
 
280 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  31.67 
 
 
281 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  29.12 
 
 
303 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  31.32 
 
 
282 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  32.38 
 
 
281 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.82 
 
 
280 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  30.25 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  30.74 
 
 
284 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  31.1 
 
 
282 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  30.47 
 
 
280 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  29.93 
 
 
281 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  31.65 
 
 
286 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  30.47 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  30.47 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  30.47 
 
 
280 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  31.43 
 
 
280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  31.43 
 
 
280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  32.85 
 
 
285 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  29.14 
 
 
290 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  30.47 
 
 
280 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  31.79 
 
 
292 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.11 
 
 
280 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.11 
 
 
280 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  31.23 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  31.05 
 
 
293 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  29.09 
 
 
280 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  25.99 
 
 
283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  30.85 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  31.75 
 
 
271 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  30.25 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  25.63 
 
 
283 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5472  degV family protein  32.16 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  29.6 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  28.78 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0772  degV family protein  31.45 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.591239  normal  0.258414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  28.06 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  28.47 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  28.72 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  28.52 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  30.22 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  28.93 
 
 
283 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  33.93 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  27.92 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  26.95 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  27.7 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  28.62 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  29.39 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  28.26 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.75 
 
 
280 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1609  degV family protein  32.25 
 
 
296 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.03 
 
 
287 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  28.88 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  27.9 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  27.9 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  27.9 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  28.52 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  28.28 
 
 
284 aa  126  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.67 
 
 
287 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.67 
 
 
287 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  25.89 
 
 
285 aa  125  7e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.67 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.67 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  26.04 
 
 
292 aa  125  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  29.07 
 
 
289 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.01 
 
 
280 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  27.54 
 
 
286 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>